40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3180 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  278  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  47.86 
 
 
135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  46.72 
 
 
135 aa  103  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1019  protein of unknown function DUF101  43.57 
 
 
139 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  38.69 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  34.59 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  33.33 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  31.16 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  29.79 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  35.11 
 
 
137 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  31.3 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  29.71 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  29.55 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  32.52 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  25.74 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  27.91 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  27.78 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  27.34 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  27.14 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  28.03 
 
 
143 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  27.97 
 
 
143 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  28.24 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  25.17 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  22.34 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  27.87 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  25.4 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  28.89 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  29.01 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  29.5 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  31.94 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1267  hypothetical cytosolic protein  31.06 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2360  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 
542 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  27.41 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  23.4 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40293  predicted protein  29.01 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  26.24 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  28.72 
 
 
138 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  26.67 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  28.46 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  24.35 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>