55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_726 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  84.06 
 
 		 138 aa  238  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  80.43 
 
 		 138 aa  232  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  33.58 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  36.5 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  36.23 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  32.61 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  33.09 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  32.37 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  33.57 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  34.85 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  31.16 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  32.62 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2360  metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 		 542 aa  73.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  31.11 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  28.37 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  26.95 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  27.66 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  28.99 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  31.16 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  27.27 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  27.74 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  27.54 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  28.47 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  25 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0902  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  31.21 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1313  hypothetical protein  27.46 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  29.29 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  30.43 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  27.01 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0373  protein of unknown function DUF101  29.1 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1267  hypothetical cytosolic protein  30.77 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  28.47 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0412  protein of unknown function DUF101  40.54 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00074949  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  23.57 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  32 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  29.41 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  22.96 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0987  hypothetical protein  25.71 
 
 		 144 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  24.82 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1019  protein of unknown function DUF101  25.74 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1615  hypothetical protein  30.83 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.307554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  25.93 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  25.93 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  23.7 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  24.64 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  28.72 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  25.56 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  25 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4796  protein of unknown function DUF101  27.14 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  23.78 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>