54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0196 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  291  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  56.2 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  64.71 
 
 
138 aa  166  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2360  metal dependent phosphohydrolase  61.19 
 
 
542 aa  161  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1313  hypothetical protein  57.97 
 
 
139 aa  161  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  60.74 
 
 
137 aa  144  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  54.81 
 
 
144 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  44.2 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  43.17 
 
 
140 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  43.12 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  34.07 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1267  hypothetical cytosolic protein  41.73 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  36.23 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  37.86 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  35.51 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0373  protein of unknown function DUF101  41.73 
 
 
142 aa  92.8  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  37.76 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  36.3 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0902  hypothetical protein  40.6 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  32.37 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  34.53 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  28.47 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  31.65 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  33.09 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  32.61 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  32.17 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  30.43 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  29.71 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  30.22 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  30.43 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  31.21 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  30.99 
 
 
143 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  33.86 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  34.29 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  32.33 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  28.37 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  30.4 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  30.71 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  32.33 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  35.21 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  26.72 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  30.5 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  32.52 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  34.07 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  31.88 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  34.33 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  29.58 
 
 
143 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1615  hypothetical protein  34.59 
 
 
143 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.307554  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  31.58 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0987  hypothetical protein  34.48 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  30.61 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  20.71 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0412  protein of unknown function DUF101  28.57 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00074949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>