56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1652 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  268  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  52.59 
 
 
135 aa  137  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  47.86 
 
 
135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1019  protein of unknown function DUF101  44.29 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  41.61 
 
 
136 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  36.69 
 
 
138 aa  89  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  36.3 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  36.3 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  35.25 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  36.43 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  35 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  34.04 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  34.33 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  35.04 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  35.82 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  36.03 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  29.37 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  28.89 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  33.88 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  31.88 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  28.36 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  33.09 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  34.31 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  30.6 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  28.89 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  27.54 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  32.06 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  31.34 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  31.47 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2360  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
542 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  29.29 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  31.11 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  25.53 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  31.91 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1313  hypothetical protein  28.68 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223315  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  33.57 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  28.97 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4796  protein of unknown function DUF101  31.88 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  26.24 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  32.95 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  27.61 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  28.36 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  29.1 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  34.29 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  29.37 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  25.55 
 
 
138 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  32.17 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  23.02 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0987  hypothetical protein  29.37 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  27.01 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1008  hypothetical protein  25.18 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.346988  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40293  predicted protein  32.03 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1005  protein of unknown function DUF101  24.83 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0947  hypothetical protein  25.35 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0412  protein of unknown function DUF101  32.43 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00074949  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  32.88 
 
 
148 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>