56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46270 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  272  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  61.48 
 
 
141 aa  177  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  60.74 
 
 
143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  61.48 
 
 
138 aa  159  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1313  hypothetical protein  56.3 
 
 
139 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223315  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2360  metal dependent phosphohydrolase  58.21 
 
 
542 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  46.67 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  50.74 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  44.93 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  44.55 
 
 
110 aa  106  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  42.03 
 
 
143 aa  103  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  35.77 
 
 
138 aa  94.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  33.58 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  34.75 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  34.31 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  32.62 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  32.61 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  35.29 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  36.76 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1267  hypothetical cytosolic protein  38.35 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  29.2 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  30.71 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  32.62 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  33.58 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  29.27 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  26.24 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  34.04 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  27.54 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  27.54 
 
 
138 aa  67  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  27.54 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  31.54 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0373  protein of unknown function DUF101  33.58 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  28.47 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0902  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  30.37 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  30.71 
 
 
165 aa  63.5  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  31.91 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  33.82 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  32.33 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  26.56 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1615  hypothetical protein  38.35 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.307554  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  33.83 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  31.58 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  31.91 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  29.17 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  37.59 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  29.41 
 
 
148 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  31.03 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0412  protein of unknown function DUF101  28.22 
 
 
159 aa  48.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00074949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1019  protein of unknown function DUF101  29.6 
 
 
139 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  26.57 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0987  hypothetical protein  31.39 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2398  hypothetical protein  32.84 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.796069  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0834  hypothetical protein  29.08 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727995  normal  0.702383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>