43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2756 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  100 
 
 
136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0412  protein of unknown function DUF101  56.6 
 
 
159 aa  168  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00074949  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2022  protein of unknown function DUF101  56.76 
 
 
148 aa  167  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.367905 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2562  protein of unknown function DUF101  61.33 
 
 
158 aa  149  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  32.41 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  31.62 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  32.39 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  32.84 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  34.59 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  34.72 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  32.09 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  28.97 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  28.47 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  34.07 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  34.06 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  32.35 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1615  hypothetical protein  35.34 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.307554  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  26.28 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  27.14 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  30.83 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  26.43 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  31.34 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  24.14 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  26.28 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  25.18 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1019  protein of unknown function DUF101  24.29 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  31.34 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  28.99 
 
 
147 aa  47  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  27.94 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  27.27 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1313  hypothetical protein  29.85 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223315  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  27.86 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  32.35 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  23.7 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  31.65 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  24.06 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  31.91 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  28.57 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  23.02 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  21.28 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  24.03 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>