30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0035 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0035  AMMECR1 domain-containing protein  100 
 
 
194 aa  380  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1112  AMMECR1 domain-containing protein  71.88 
 
 
198 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.820877 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0073  hypothetical protein  69.79 
 
 
198 aa  265  4e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.135559  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0065  AMMECR1 domain-containing protein  66.67 
 
 
198 aa  249  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.582871  normal  0.222281 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0319  AMMECR1 domain-containing protein  30.43 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.520207  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0360  AMMECR1 domain-containing protein  30.88 
 
 
219 aa  58.5  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2169  AMMECR1 domain-containing protein  28.14 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0138  AMMECR1 domain-containing protein  27.72 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.495335  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1005  AMMECR1 domain-containing protein  29.15 
 
 
221 aa  55.1  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.320015  hitchhiker  0.0000637558 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0529  AMMECR1 domain protein  28.26 
 
 
181 aa  55.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673867  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1061  AMMECR1 domain-containing protein  24.14 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0011  AMMECR1 domain-containing protein  27.93 
 
 
213 aa  52  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0748  AMMECR1 domain-containing protein  30.5 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1700  AMMECR1 domain-containing protein  25 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00928543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1807  hypothetical protein  28.64 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0216  AMMECR1 domain-containing protein  26.9 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0346  AMMECR1 domain-containing protein  23.15 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325278  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0552  AMMECR1 domain protein  27.51 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.680771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1565  AMMECR1 domain-containing protein  24.5 
 
 
208 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.326234 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1497  AMMECR1 domain protein  25.95 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1210  hypothetical protein  24.84 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2231  AMMECR1 domain-containing protein  27.78 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1206  hypothetical protein  31.51 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.623161  normal  0.104237 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0009  AMMECR1 domain-containing protein  28.32 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.717418 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0124  hypothetical protein  25.91 
 
 
208 aa  42  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3512  AMMECR1 domain-containing protein  24.24 
 
 
182 aa  42  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0800237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1832  AMMECR1 domain protein  28.88 
 
 
193 aa  41.6  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.262195  normal  0.158131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2560  AMMECR1 domain protein  29.22 
 
 
183 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.88938e-32 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1459  AMMECR1 domain-containing protein  29.14 
 
 
173 aa  41.6  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0154  AMMECR1 domain-containing protein  29.95 
 
 
221 aa  41.2  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.502826  normal  0.0201385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>