More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2830 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2830  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  100 
 
 
226 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02289  glutamine amido-transferase  64.71 
 
 
210 aa  259  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2451  anthranilate synthase component II  53.64 
 
 
240 aa  245  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2130  anthranilate synthase component II  58.12 
 
 
199 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1428  anthranilate synthase component II  56.78 
 
 
211 aa  231  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2668  anthranilate synthase component II  55.03 
 
 
193 aa  228  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019593 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2205  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.53 
 
 
531 aa  227  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2043  anthranilate synthase component II  55.03 
 
 
192 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1933  anthranilate synthase component II  55.03 
 
 
192 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.490866  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01237  bifunctional indole-3-glycerol-phosphate synthase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 
531 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2385  anthranilate phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 
531 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.101159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1895  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 
531 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854588 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2364  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 
531 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01247  hypothetical protein  53.12 
 
 
531 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1372  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 
531 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1462  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 
531 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0572778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1869  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 
531 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144467 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2173  anthranilate synthase component II  53.44 
 
 
192 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291685  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1488  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  53.44 
 
 
531 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1851  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.08 
 
 
531 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.468374  hitchhiker  0.00404515 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1856  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.08 
 
 
531 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1604  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.08 
 
 
531 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262187  hitchhiker  0.00317716 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2802  anthranilate synthase component II  55.96 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2723  anthranilate synthase component II  55.96 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1422  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.08 
 
 
531 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2305  anthranilate synthase component II  53.97 
 
 
192 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1663  anthranilate synthase component II  55.96 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0146464  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1914  bifunctional glutamine amidotransferase/anthranilate phosphoribosyltransferase  52.08 
 
 
531 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000009579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2006  anthranilate synthase component II  53.97 
 
 
192 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2404  anthranilate synthase component II  56.48 
 
 
200 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02759  anthranilate synthase component II  48.73 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1059  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  50.5 
 
 
200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1685  anthranilate synthase component II  51.78 
 
 
201 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2702  anthranilate synthase component II  55.44 
 
 
207 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1933  anthranilate synthase component II  53.44 
 
 
192 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1589  anthranilate synthase component II  54.31 
 
 
204 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003087  anthranilate synthase amidotransferase component  48.22 
 
 
202 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3523  glutamine amido-transferase  52.58 
 
 
209 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2913  anthranilate synthase component II  53.4 
 
 
201 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970253  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1153  anthranilate synthase component II  50.5 
 
 
202 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0795  anthranilate synthase component II  50.53 
 
 
203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1527  anthranilate synthase component II  55.33 
 
 
202 aa  207  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452213  normal  0.0147223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1519  anthranilate synthase component II  55.44 
 
 
202 aa  203  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0790647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3020  anthranilate synthase component II  55.73 
 
 
202 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1461  anthranilate synthase component II  54.92 
 
 
202 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2252  anthranilate synthase component II  51.67 
 
 
202 aa  198  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0075  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  40.51 
 
 
220 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4125  anthranilate synthase, component II  43.16 
 
 
191 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1868  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  40.31 
 
 
195 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2261  anthranilate synthase component II  42.47 
 
 
189 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1850  anthranilate synthase component II  43.46 
 
 
193 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2048  anthranilate synthase component II  41.67 
 
 
187 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0195497  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0575  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  42.02 
 
 
195 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0267305  normal  0.552155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1357  anthranilate synthase component II  41.21 
 
 
195 aa  148  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.881457  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3196  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  40.91 
 
 
190 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0298  anthranilate synthase component II  43.55 
 
 
187 aa  148  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  40 
 
 
195 aa  148  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1955  anthranilate synthase component II  41.94 
 
 
189 aa  148  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  39.79 
 
 
195 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  43.55 
 
 
204 aa  147  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0356  anthranilate synthase component II  41.36 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.369979  normal  0.760779 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  43.55 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4160  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  40.43 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0077  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  39.47 
 
 
195 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0201  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  38.17 
 
 
200 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1254  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  42.47 
 
 
198 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  42.47 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.708014  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1190  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  42.47 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00563763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1394  anthranilate synthase component II  39.39 
 
 
195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000298734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0078  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  39.47 
 
 
195 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000982059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0505  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  42.02 
 
 
201 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  41.5 
 
 
192 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1145  anthranilate synthase component II  43.09 
 
 
195 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0613  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  40.1 
 
 
191 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2776  anthranilate synthase component II  44.1 
 
 
198 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000091878  hitchhiker  0.00000280107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4052  anthranilate synthase component II  40.7 
 
 
195 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0375886  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2938  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  41.18 
 
 
191 aa  144  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  41.36 
 
 
192 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  41.36 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.765276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0068  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  38.95 
 
 
195 aa  144  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2749  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  43.85 
 
 
197 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.466062  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  38.95 
 
 
195 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4187  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  39.68 
 
 
199 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  42.25 
 
 
188 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0375  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  40.2 
 
 
193 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.083636 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1292  anthranilate synthase component II  40.2 
 
 
195 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.290933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0352  para-aminobenzoate synthase component II  41.18 
 
 
187 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0081  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  38.95 
 
 
195 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  40.84 
 
 
191 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0019  anthranilate synthase, component II  40.89 
 
 
213 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0606  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit  40.1 
 
 
191 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00400563 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2037  anthranilate synthase component II  40.11 
 
 
187 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  40.1 
 
 
192 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03211  para-aminobenzoate synthase component II  41.4 
 
 
187 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3830  para-aminobenzoate synthase component II  41.4 
 
 
187 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1219  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  41.4 
 
 
188 aa  143  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.607602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1317  anthranilate synthase component II  39.7 
 
 
195 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11197e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1098  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  41.21 
 
 
211 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3736  para-aminobenzoate synthase component II  41.4 
 
 
187 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3302  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  42.02 
 
 
189 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>