38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2621 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2621  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  100 
 
 		 180 aa  360  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30710  putative activator of osmoprotectant transporter  81.71 
 
 		 177 aa  235  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174135  hitchhiker  0.0000189108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3083  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  63.25 
 
 		 169 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3555  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  66.88 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2182  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  66.88 
 
 		 171 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1789  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  67.11 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5764  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  48.81 
 
 		 224 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733693  normal  0.933198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6008  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  48.81 
 
 		 284 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6155  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  49.7 
 
 		 398 aa  144  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168417  normal  0.179511 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5820  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  49.35 
 
 		 223 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231664  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6185  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  49.35 
 
 		 223 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.942163  normal  0.876638 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7730  ProQ, activator of osmoprotectant transporter ProP  48.39 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6664  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  49.35 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1492  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  43.1 
 
 		 222 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1323  ProP effector  50.35 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.929512  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1083  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  41.24 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1540  ProP effector  47.02 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0041  ProQ protein  48.3 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2080  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  44.57 
 
 		 284 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0898874  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1453  ProP effector  48.3 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2177  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  41.44 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2615  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  47.62 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1663  hypothetical protein  32 
 
 		 121 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1657  hypothetical protein  32 
 
 		 123 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1852  putative solute/DNA competence effector  32.77 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2140  putative solute/DNA competence effector  31.93 
 
 		 252 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2188  putative solute/DNA competence effector  33.71 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.345813  normal  0.724108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1584  putative solute/DNA competence effector  32.17 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0133  hypothetical protein  28.68 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4697  ProQ family protein  32.14 
 
 		 114 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1934  putative solute/DNA competence effector  29.73 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.854531  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6423  hypothetical protein  33.85 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.969104 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0148  hypothetical protein  32.05 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1844  putative solute/DNA competence effector  30.43 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0245  hypothetical protein  29.13 
 
 		 319 aa  42  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1992  putative solute/DNA competence effector  33.7 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025199  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0307  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  30.17 
 
 		 288 aa  41.2  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2811  putative solute/DNA competence effector  25.53 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00532714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>