59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_30710 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_30710  putative activator of osmoprotectant transporter  100 
 
 		 177 aa  350  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174135  hitchhiker  0.0000189108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2621  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  84.15 
 
 		 180 aa  270  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3555  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  64.71 
 
 		 173 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2182  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  64.71 
 
 		 171 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3083  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  59.41 
 
 		 169 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1789  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  65.56 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5764  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  45.24 
 
 		 224 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733693  normal  0.933198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6008  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  45.24 
 
 		 284 aa  131  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6155  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  46.11 
 
 		 398 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168417  normal  0.179511 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1323  ProP effector  51.43 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.929512  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5820  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  44.23 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231664  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6185  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  44.23 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.942163  normal  0.876638 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7730  ProQ, activator of osmoprotectant transporter ProP  43.31 
 
 		 220 aa  121  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1492  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  38.42 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6664  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  42.68 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1453  ProP effector  43.59 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0041  ProQ protein  43.59 
 
 		 200 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1540  ProP effector  46.36 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1083  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  37.24 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2080  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  40 
 
 		 284 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0898874  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2615  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  46.71 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2177  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  38.67 
 
 		 251 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2140  putative solute/DNA competence effector  30.99 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1852  putative solute/DNA competence effector  31.5 
 
 		 252 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1992  putative solute/DNA competence effector  31.85 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1663  hypothetical protein  32.32 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0148  hypothetical protein  29.25 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1657  hypothetical protein  32.32 
 
 		 123 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1844  putative solute/DNA competence effector  31.67 
 
 		 243 aa  48.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3812  activator of osmoprotectant transporter  31.97 
 
 		 228 aa  48.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1782  putative solute/DNA competence effector  33.08 
 
 		 237 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0742372  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1671  putative solute/DNA competence effector  33.08 
 
 		 237 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000024891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2664  putative solute/DNA competence effector  33.08 
 
 		 237 aa  47.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764643  normal  0.0215757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1584  putative solute/DNA competence effector  32.2 
 
 		 219 aa  47.8  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0133  hypothetical protein  29.25 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1934  putative solute/DNA competence effector  32.74 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.854531  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1811  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  30.4 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.179036  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1033  hypothetical protein  30.37 
 
 		 239 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0842196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2401  putative solute/DNA competence effector  31.52 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6423  hypothetical protein  32 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.969104 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2188  putative solute/DNA competence effector  32.97 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.345813  normal  0.724108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1985  putative solute/DNA competence effector  30.43 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000228326  hitchhiker  0.0069158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4697  ProQ family protein  32.14 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2047  putative solute/DNA competence effector  30.43 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2118  putative solute/DNA competence effector  31.52 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00110468  hitchhiker  0.0000659128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01790  hypothetical protein  30.43 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2564  putative solute/DNA competence effector  30.43 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000584376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1469  putative solute/DNA competence effector  30.43 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00111252  normal  0.239206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1285  putative solute/DNA competence effector  30.43 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000538186  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1989  putative solute/DNA competence effector  30.43 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00261686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1801  putative solute/DNA competence effector  30.43 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.304179  normal  0.0872497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1922  putative solute/DNA competence effector  30.43 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.31825e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01802  putative solute/DNA competence effector  30.43 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1356  putative solute/DNA competence effector  30.43 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120043  normal  0.2491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0245  hypothetical protein  30.63 
 
 		 319 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2060  putative solute/DNA competence effector  30.43 
 
 		 232 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2811  putative solute/DNA competence effector  28.57 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00532714  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2099  putative solute/DNA competence effector  29.35 
 
 		 232 aa  41.2  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000516503  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0187  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  32.91 
 
 		 289 aa  40.8  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>