63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6155 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6155  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  100 
 
 
398 aa  793    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168417  normal  0.179511 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6185  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  77.58 
 
 
223 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.942163  normal  0.876638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5764  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  86.17 
 
 
224 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733693  normal  0.933198 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5820  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  77.58 
 
 
223 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231664  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6008  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  86.56 
 
 
284 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7730  ProQ, activator of osmoprotectant transporter ProP  76.36 
 
 
220 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6664  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  73.66 
 
 
224 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0041  ProQ protein  54.12 
 
 
200 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1323  ProP effector  55 
 
 
171 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.929512  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1540  ProP effector  56.5 
 
 
183 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1453  ProP effector  56.5 
 
 
179 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2080  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  54.3 
 
 
284 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0898874  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1492  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  54.55 
 
 
222 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2177  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  51.38 
 
 
251 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1083  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  51.48 
 
 
218 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2621  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  51.18 
 
 
180 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176786  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2615  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  51.19 
 
 
178 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1789  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  43.71 
 
 
179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30710  putative activator of osmoprotectant transporter  44.59 
 
 
177 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174135  hitchhiker  0.0000189108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3555  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  42.77 
 
 
173 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2182  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  42.77 
 
 
171 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3083  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  39.18 
 
 
169 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2188  putative solute/DNA competence effector  36.08 
 
 
207 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.345813  normal  0.724108 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0133  hypothetical protein  40.58 
 
 
230 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0148  hypothetical protein  40.58 
 
 
230 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2401  putative solute/DNA competence effector  33.33 
 
 
227 aa  53.1  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1356  putative solute/DNA competence effector  35.96 
 
 
232 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120043  normal  0.2491 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1801  putative solute/DNA competence effector  35.96 
 
 
232 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.304179  normal  0.0872497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1985  putative solute/DNA competence effector  34.83 
 
 
228 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000228326  hitchhiker  0.0069158 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2060  putative solute/DNA competence effector  35.96 
 
 
232 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1922  putative solute/DNA competence effector  35.96 
 
 
232 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.31825e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1811  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  33.33 
 
 
232 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.179036  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2564  putative solute/DNA competence effector  35.96 
 
 
232 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000584376  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01790  hypothetical protein  35.96 
 
 
232 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01802  putative solute/DNA competence effector  35.96 
 
 
232 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7731  hypothetical protein  82.14 
 
 
197 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1657  hypothetical protein  34.95 
 
 
123 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1584  putative solute/DNA competence effector  33.65 
 
 
219 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1663  hypothetical protein  34.95 
 
 
121 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1469  putative solute/DNA competence effector  34.83 
 
 
228 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00111252  normal  0.239206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2099  putative solute/DNA competence effector  34.83 
 
 
232 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000516503  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2047  putative solute/DNA competence effector  34.83 
 
 
228 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1285  putative solute/DNA competence effector  34.83 
 
 
228 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000538186  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1989  putative solute/DNA competence effector  34.83 
 
 
228 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00261686  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2811  putative solute/DNA competence effector  31.82 
 
 
220 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00532714  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1844  putative solute/DNA competence effector  30.82 
 
 
243 aa  49.7  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1992  putative solute/DNA competence effector  31.53 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1934  putative solute/DNA competence effector  34.15 
 
 
212 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.854531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2118  putative solute/DNA competence effector  34.44 
 
 
236 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00110468  hitchhiker  0.0000659128 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1543  putative solute/DNA competence effector  30.77 
 
 
210 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1671  putative solute/DNA competence effector  34.83 
 
 
237 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000024891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1782  putative solute/DNA competence effector  34.83 
 
 
237 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0742372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2664  putative solute/DNA competence effector  34.83 
 
 
237 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764643  normal  0.0215757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003430  ProQ protein  30.09 
 
 
208 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000470709  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02347  putative solute/DNA competence effector  35.8 
 
 
220 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1801  putative solute/DNA competence effector  34.09 
 
 
215 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925744  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2140  putative solute/DNA competence effector  33.71 
 
 
252 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1852  putative solute/DNA competence effector  33.71 
 
 
252 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0754  ProP effector  36.9 
 
 
119 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02001  putative solute/DNA competence effector  32.58 
 
 
222 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2203  putative solute/DNA competence effector  31.82 
 
 
213 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.702868  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1070  putative solute/DNA competence effector  35.37 
 
 
211 aa  43.5  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.265506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2229  putative solute/DNA competence effector  32.93 
 
 
203 aa  43.1  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.180207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>