39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3307 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3307  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0203584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2438  hypothetical protein  98.41 
 
 		 126 aa  245  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.942157  normal  0.831641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2964  hypothetical protein  87.3 
 
 		 126 aa  189  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529567  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2170  hypothetical protein  78.57 
 
 		 126 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4134  hypothetical protein  64.29 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2297  Rho termination factor domain-containing protein  59.68 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189843  hitchhiker  0.0000124515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  55.97 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5599  hypothetical protein  55.22 
 
 		 135 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0071  hypothetical protein  80 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06830  hypothetical protein  64.47 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6780  hypothetical protein  77.78 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0507  hypothetical protein  75.56 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.508219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2000  hypothetical protein  76.09 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0921429  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3262  hypothetical protein  77.27 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0342  hypothetical protein  75.56 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.678851  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5905  hypothetical protein  76.74 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4414  hypothetical protein  74.42 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4351  hypothetical protein  73.33 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0792  hypothetical protein  72.73 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.464453  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5175  hypothetical protein  74.42 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3948  hypothetical protein  69.57 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3568  hypothetical protein  76.74 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961922  normal  0.971023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3140  hypothetical protein  48.04 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0293787  normal  0.397733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3462  hypothetical protein  48.04 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3337  hypothetical protein  45.71 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2259  hypothetical protein  65.22 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0156139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2261  hypothetical protein  74.42 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3004  hypothetical protein  64.44 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674006 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22380  hypothetical protein  36.59 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4175  hypothetical protein  36.07 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3522  hypothetical protein  36.07 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4856  hypothetical protein  37.7 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.620342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1391  hypothetical protein  34.43 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756884  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1024  hypothetical protein  32.76 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1105  hypothetical protein  32.76 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  51.16 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  59.46 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2797  hypothetical protein  32.8 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00976931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  61.29 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>