18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1105 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1105  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  218  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1024  hypothetical protein  98.15 
 
 
108 aa  212  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3522  hypothetical protein  75 
 
 
108 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4856  hypothetical protein  65.09 
 
 
109 aa  137  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.620342  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1391  hypothetical protein  62.04 
 
 
108 aa  130  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4175  hypothetical protein  62.26 
 
 
109 aa  130  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22380  hypothetical protein  58.49 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2797  hypothetical protein  60 
 
 
111 aa  116  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00976931  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3189  hypothetical protein  54.72 
 
 
55 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.947919  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3307  hypothetical protein  32.76 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0203584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2438  hypothetical protein  32.76 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.942157  normal  0.831641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2170  hypothetical protein  33.62 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438765  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2297  Rho termination factor domain-containing protein  32.17 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189843  hitchhiker  0.0000124515 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0112  hypothetical protein  39.39 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5599  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4134  hypothetical protein  33.62 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225692  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4476  hypothetical protein  37.97 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.696383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>