22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22380 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_22380  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  212  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1391  hypothetical protein  64.15 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4856  hypothetical protein  63.3 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.620342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3522  hypothetical protein  60.38 
 
 		 108 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1105  hypothetical protein  58.49 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1024  hypothetical protein  58.49 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2797  hypothetical protein  58.33 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00976931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4175  hypothetical protein  56.88 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3307  hypothetical protein  36.59 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0203584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2438  hypothetical protein  35.77 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.942157  normal  0.831641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3189  hypothetical protein  50.91 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2170  hypothetical protein  35.09 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  35.58 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5599  hypothetical protein  34.68 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2297  Rho termination factor domain-containing protein  30.09 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189843  hitchhiker  0.0000124515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  34.58 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2964  hypothetical protein  32.28 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529567  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01038  hypothetical protein  48.94 
 
 		 87 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0473132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  33.65 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0112  hypothetical protein  41.94 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>