26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1391 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1391  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4175  hypothetical protein  73.83 
 
 		 109 aa  158  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3522  hypothetical protein  65.74 
 
 		 108 aa  143  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4856  hypothetical protein  64.49 
 
 		 109 aa  141  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.620342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2797  hypothetical protein  66.36 
 
 		 111 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00976931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1105  hypothetical protein  62.04 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22380  hypothetical protein  64.15 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1024  hypothetical protein  61.11 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2170  hypothetical protein  36.09 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2297  Rho termination factor domain-containing protein  33.88 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189843  hitchhiker  0.0000124515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3307  hypothetical protein  34.43 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0203584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2438  hypothetical protein  34.43 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.942157  normal  0.831641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2964  hypothetical protein  34.43 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529567  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  31.34 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5599  hypothetical protein  31.34 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3189  hypothetical protein  48.98 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4990  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.604608  normal  0.264456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3140  hypothetical protein  32.56 
 
 		 105 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0293787  normal  0.397733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3462  hypothetical protein  32.56 
 
 		 105 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0112  hypothetical protein  49.02 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4476  hypothetical protein  34.18 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4940  hypothetical protein  34.18 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.260804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0071  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1812  hypothetical protein  58.06 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4134  hypothetical protein  32.8 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0342  hypothetical protein  36.62 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.678851  normal  0.264945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>