18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2797 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2797  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  220  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00976931  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1391  hypothetical protein  66.36 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4856  hypothetical protein  65.14 
 
 
109 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.620342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4175  hypothetical protein  64.22 
 
 
109 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22380  hypothetical protein  58.33 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1105  hypothetical protein  60 
 
 
108 aa  116  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1024  hypothetical protein  60 
 
 
108 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3522  hypothetical protein  60 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  36.23 
 
 
135 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3189  hypothetical protein  56.86 
 
 
55 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.947919  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5599  hypothetical protein  36.23 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0112  hypothetical protein  41.94 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4990  hypothetical protein  37.97 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.604608  normal  0.264456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2170  hypothetical protein  34.38 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438765  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2438  hypothetical protein  32.79 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.942157  normal  0.831641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3307  hypothetical protein  32.8 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0203584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4940  hypothetical protein  35.44 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.260804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4476  hypothetical protein  35.44 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.696383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>