19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1024 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1024  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1105  hypothetical protein  98.15 
 
 		 108 aa  212  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3522  hypothetical protein  74.07 
 
 		 108 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4856  hypothetical protein  65.09 
 
 		 109 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.620342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1391  hypothetical protein  61.11 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4175  hypothetical protein  61.32 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22380  hypothetical protein  58.49 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2797  hypothetical protein  60 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00976931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3189  hypothetical protein  54.72 
 
 		 55 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3307  hypothetical protein  32.76 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0203584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2170  hypothetical protein  33.62 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2297  Rho termination factor domain-containing protein  32.17 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189843  hitchhiker  0.0000124515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  34.13 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2438  hypothetical protein  32.76 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.942157  normal  0.831641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4134  hypothetical protein  34.48 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0112  hypothetical protein  39.39 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  34.55 
 
 		 141 aa  42  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2964  hypothetical protein  30.17 
 
 		 126 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529567  normal  0.9373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>