30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3140 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3140  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  203  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0293787  normal  0.397733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3462  hypothetical protein  99.05 
 
 		 105 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3337  hypothetical protein  92.38 
 
 		 105 aa  153  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3262  hypothetical protein  72.82 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6780  hypothetical protein  68.69 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3568  hypothetical protein  90.12 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961922  normal  0.971023 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5175  hypothetical protein  81 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4414  hypothetical protein  71.29 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0507  hypothetical protein  66.02 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.508219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3307  hypothetical protein  53.61 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0203584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0071  hypothetical protein  59.41 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2438  hypothetical protein  52.58 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.942157  normal  0.831641 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3948  hypothetical protein  66 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0792  hypothetical protein  64.65 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.464453  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0342  hypothetical protein  59.62 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.678851  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06830  hypothetical protein  81.82 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2261  hypothetical protein  84.09 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5905  hypothetical protein  69.7 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  77.27 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5599  hypothetical protein  75 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2297  Rho termination factor domain-containing protein  72.73 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189843  hitchhiker  0.0000124515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2170  hypothetical protein  75 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2259  hypothetical protein  61.05 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0156139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2964  hypothetical protein  72.73 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529567  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2000  hypothetical protein  74.42 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0921429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4351  hypothetical protein  70.45 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0401551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4134  hypothetical protein  63.64 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3004  hypothetical protein  60.87 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3522  hypothetical protein  38.55 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1391  hypothetical protein  32.56 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>