28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3568 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3568  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961922  normal  0.971023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3337  hypothetical protein  85.58 
 
 
105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3462  hypothetical protein  84.62 
 
 
105 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3140  hypothetical protein  86.14 
 
 
105 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0293787  normal  0.397733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3262  hypothetical protein  75.96 
 
 
104 aa  120  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977805  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5175  hypothetical protein  82 
 
 
105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6780  hypothetical protein  66.67 
 
 
104 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566411  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0507  hypothetical protein  66.99 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.508219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4414  hypothetical protein  69.61 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379246  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0071  hypothetical protein  54.9 
 
 
176 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3307  hypothetical protein  73.21 
 
 
126 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0203584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2261  hypothetical protein  82.14 
 
 
103 aa  84  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06830  hypothetical protein  86.36 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2438  hypothetical protein  71.43 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.942157  normal  0.831641 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3948  hypothetical protein  65 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0342  hypothetical protein  61.54 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.678851  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0792  hypothetical protein  63.92 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.464453  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5905  hypothetical protein  69.7 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675845  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  77.27 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5599  hypothetical protein  77.27 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2297  Rho termination factor domain-containing protein  75 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189843  hitchhiker  0.0000124515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2170  hypothetical protein  77.27 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438765  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2259  hypothetical protein  63.16 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0156139  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2964  hypothetical protein  75 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529567  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4134  hypothetical protein  51.49 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225692  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2000  hypothetical protein  76.74 
 
 
104 aa  66.6  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0921429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4351  hypothetical protein  72.73 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0401551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3004  hypothetical protein  63.04 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>