30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5175 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5175  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  199  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3262  hypothetical protein  80.39 
 
 
104 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977805  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6780  hypothetical protein  68.57 
 
 
104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566411  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3140  hypothetical protein  81 
 
 
105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0293787  normal  0.397733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3462  hypothetical protein  81 
 
 
105 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3337  hypothetical protein  79 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0507  hypothetical protein  66.67 
 
 
105 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.508219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3568  hypothetical protein  80.95 
 
 
104 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961922  normal  0.971023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3948  hypothetical protein  65.09 
 
 
109 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4414  hypothetical protein  67 
 
 
102 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379246  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5905  hypothetical protein  70.48 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675845  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0071  hypothetical protein  55 
 
 
176 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2261  hypothetical protein  89.06 
 
 
103 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0792  hypothetical protein  64.71 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.464453  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3307  hypothetical protein  71.43 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0203584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0342  hypothetical protein  65 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.678851  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2438  hypothetical protein  69.64 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.942157  normal  0.831641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64490  hypothetical protein  77.27 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5599  hypothetical protein  75 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06830  hypothetical protein  53.12 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2170  hypothetical protein  75 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438765  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2259  hypothetical protein  60 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0156139  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2000  hypothetical protein  76.74 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0921429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2964  hypothetical protein  70.45 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529567  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4134  hypothetical protein  52.08 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225692  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2297  Rho termination factor domain-containing protein  66.67 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189843  hitchhiker  0.0000124515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4351  hypothetical protein  68.18 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0401551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3004  hypothetical protein  65.22 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3522  hypothetical protein  42.86 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4175  hypothetical protein  48.89 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.280126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>