25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1804 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  269  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  64.39 
 
 		 134 aa  176  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  63.64 
 
 		 131 aa  169  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  62.41 
 
 		 136 aa  164  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  60.8 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  60.8 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  60.61 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  61.72 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  65.29 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  59.2 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  61.48 
 
 		 134 aa  156  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  61.03 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  58.99 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  62.2 
 
 		 141 aa  150  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  57.03 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  57.03 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  60.77 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  62.12 
 
 		 153 aa  136  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  57.03 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  60.53 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  42.86 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2443  ChaB  36.23 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0461  putative cation transport regulato, ChaB  32.89 
 
 		 76 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22380  hypothetical protein  51.06 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  60.61 
 
 		 188 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>