More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1398 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_14881  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  86.31 
 
 
410 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1398  FolC bifunctional protein  100 
 
 
410 aa  825    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15011  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  87.29 
 
 
410 aa  725    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14631  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  67.65 
 
 
410 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17221  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  44.84 
 
 
412 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0868  folylpolyglutamate synthetase  45.31 
 
 
389 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.790546  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19851  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  39.65 
 
 
413 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0732491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0857  FolC bifunctional protein  39.29 
 
 
404 aa  325  1e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1535  folylpolyglutamate synthetase  39.54 
 
 
415 aa  316  4e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13501  putative bifunctional dihydrofolate/folylpolyglutamate synthase  48.36 
 
 
413 aa  316  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  31.34 
 
 
425 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  30.84 
 
 
412 aa  212  7.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  34.88 
 
 
418 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  34.63 
 
 
418 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.72 
 
 
438 aa  209  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  31.81 
 
 
420 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  30.83 
 
 
427 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  31.73 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  31.41 
 
 
459 aa  186  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  30.15 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  32.84 
 
 
425 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.81 
 
 
441 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  30.85 
 
 
424 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  31.82 
 
 
441 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  32.94 
 
 
424 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  29.36 
 
 
447 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2632  FolC bifunctional protein  32.5 
 
 
403 aa  176  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.68 
 
 
427 aa  173  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  32.27 
 
 
407 aa  172  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  30.19 
 
 
440 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  31.44 
 
 
437 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.86 
 
 
466 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  32.66 
 
 
435 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  31.32 
 
 
404 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  31.18 
 
 
422 aa  167  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  29.41 
 
 
431 aa  166  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  31.54 
 
 
424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  34.1 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  31.25 
 
 
437 aa  163  6e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  31.04 
 
 
424 aa  163  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  30.3 
 
 
453 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  31.49 
 
 
428 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  31.84 
 
 
438 aa  160  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  29.98 
 
 
438 aa  160  6e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  29.13 
 
 
433 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  30.98 
 
 
432 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  31.78 
 
 
424 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  28.32 
 
 
440 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  28.03 
 
 
422 aa  157  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.4 
 
 
443 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  31.21 
 
 
424 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  30.1 
 
 
438 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  26.62 
 
 
878 aa  156  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2502  FolC bifunctional protein  31.42 
 
 
389 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  30.86 
 
 
422 aa  155  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  29.62 
 
 
439 aa  153  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1117  folylpolyglutamate synthase  28.81 
 
 
420 aa  153  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1591  FolC bifunctional protein  32.5 
 
 
412 aa  153  5e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  27.85 
 
 
813 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  30.6 
 
 
429 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  31.32 
 
 
428 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  30.27 
 
 
431 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  30.59 
 
 
427 aa  149  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  30.42 
 
 
457 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  29.09 
 
 
810 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  28.3 
 
 
453 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  30.21 
 
 
425 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  31.41 
 
 
434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  28.5 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  29.22 
 
 
437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04384  FPGS, folylpolyglutamate synthase (Eurofung)  28.5 
 
 
415 aa  146  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644427  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  28.74 
 
 
426 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  30.12 
 
 
428 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  28.61 
 
 
425 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  28.84 
 
 
454 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  30.43 
 
 
444 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  28.02 
 
 
432 aa  143  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47181  folylpolyglutamate synthase  30.79 
 
 
438 aa  143  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.792612 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0733  folylpolyglutamate synthase  31.31 
 
 
441 aa  143  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.136275  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  31.33 
 
 
413 aa  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  28.57 
 
 
419 aa  142  8e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  29.53 
 
 
413 aa  142  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  29.52 
 
 
435 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0455  folylpolyglutamate synthase  28.39 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  29.52 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  30.14 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  28.01 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  28.37 
 
 
429 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  27.73 
 
 
442 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  27.23 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  29.59 
 
 
437 aa  140  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  32.63 
 
 
429 aa  139  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  29.55 
 
 
437 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  25.53 
 
 
443 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  31.96 
 
 
431 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  34.26 
 
 
410 aa  139  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  32.91 
 
 
404 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  28.18 
 
 
421 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  27.27 
 
 
847 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  30.65 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>