56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88209 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_88209  Fungal specific transcription factor  100 
 
 
1028 aa  2143    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0520649  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82123  Fungal transcriptional regulatory protein  37.57 
 
 
1080 aa  622  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.600944 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81861  Fungal transcriptional regulatory protein  34.23 
 
 
1095 aa  560  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518071  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56468  Fungal transcriptional regulatory protein  34.98 
 
 
876 aa  516  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753603  normal  0.102552 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76670  Fungal transcriptional regulatory protein  34.76 
 
 
1026 aa  506  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_935  Fungal transcriptional regulatory protein  34.13 
 
 
760 aa  472  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.664373 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53992  CYP1/HAP1-like protein  28.23 
 
 
758 aa  310  8e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28000  Fungal-specific transcription factor  25.95 
 
 
858 aa  261  4e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395949  normal  0.0721946 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30770  Fungal transcriptional regulatory protein  30.42 
 
 
759 aa  245  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00132045  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29444  Fungal specific transcription factor  28.73 
 
 
1135 aa  238  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31115  zinc finger transcription factor  27.52 
 
 
765 aa  204  8e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56968  positive regulator of cytochrome C genes CYC1 and CYC7  28.35 
 
 
1085 aa  110  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.489386 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58009  Fungal transcriptional regulatory protein  27.6 
 
 
1047 aa  77.8  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.513512  normal  0.0535661 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01518  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  33.33 
 
 
825 aa  58.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650204  normal  0.31742 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08894  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  43.48 
 
 
871 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487487  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05052  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  36.71 
 
 
715 aa  54.7  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000607074  hitchhiker  0.0000000000000818279 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01550  hypothetical protein  38.33 
 
 
684 aa  54.3  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07332  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  39.71 
 
 
745 aa  52.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03369  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  51.43 
 
 
773 aa  52  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10638  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  34.09 
 
 
759 aa  52  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0597746  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04837  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.28 
 
 
684 aa  51.6  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355797  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32517  predicted protein  48 
 
 
617 aa  51.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.475893  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08125  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  44.44 
 
 
832 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.350651 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03860  nucleus protein, putative  52.63 
 
 
1043 aa  51.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00853  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  32.1 
 
 
678 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02030  nucleus protein, putative  45.65 
 
 
1012 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.614531  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01820  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  47.06 
 
 
1030 aa  50.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07971  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.28 
 
 
665 aa  50.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.145965 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08079  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  31.46 
 
 
680 aa  49.7  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0152693  normal  0.153171 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11793  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  47.06 
 
 
541 aa  49.7  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.617651  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03820  expressed protein  46.67 
 
 
737 aa  49.7  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06293  acuM, Zn(II)2Cys6 transcription factor involved in transcription control of gluconeogenisis (Eurofung)  32.79 
 
 
522 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02820  nucleus protein, putative  39.22 
 
 
1138 aa  49.3  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.230984  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08355  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  29.41 
 
 
526 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01303  ScfA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1WD27]  32.43 
 
 
729 aa  48.5  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467312  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10979  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  24.44 
 
 
673 aa  48.5  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.697812  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01641  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  26.92 
 
 
681 aa  48.5  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293594  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08441  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  30.11 
 
 
749 aa  48.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.739366  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77215  transcriptional regulator Regulator of drug sensitivity (RDS2)  38.64 
 
 
565 aa  48.1  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03050  Putative Zn(II)2Cys6 transcription facto (Eurofung)  34.33 
 
 
804 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.328433 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33678  predicted protein  35.71 
 
 
673 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01678  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  27.12 
 
 
741 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02852  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  37.21 
 
 
1018 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05859  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  34.83 
 
 
555 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0578615 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06430  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.07 
 
 
746 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0018696  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47398  zinc finger transcription factor of the Zn(2)-Cys(6) binuclear cluster domain type  47.5 
 
 
800 aa  47.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.654245  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10192  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  27.08 
 
 
755 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0382618 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00388  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  36.96 
 
 
825 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00480  expressed protein  44.74 
 
 
864 aa  46.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.42245  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03190  nucleus protein, putative  28.4 
 
 
1060 aa  46.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08506  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  42.5 
 
 
768 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.359432  normal  0.0268522 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10659  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  29.89 
 
 
687 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10912  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  35.14 
 
 
448 aa  45.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.671703  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07163  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  40 
 
 
739 aa  45.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946609  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77168  transcriptional regulator  39.53 
 
 
907 aa  44.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07343  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  52.94 
 
 
612 aa  44.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.751181  normal  0.432497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>