36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56968 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_56968  positive regulator of cytochrome C genes CYC1 and CYC7  100 
 
 		 1085 aa  2253    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.489386 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_935  Fungal transcriptional regulatory protein  23.44 
 
 		 760 aa  111  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.664373 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82123  Fungal transcriptional regulatory protein  22.41 
 
 		 1080 aa  107  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.600944 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81861  Fungal transcriptional regulatory protein  26.63 
 
 		 1095 aa  94.7  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53992  CYP1/HAP1-like protein  22.05 
 
 		 758 aa  94.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56468  Fungal transcriptional regulatory protein  26.47 
 
 		 876 aa  94.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753603  normal  0.102552 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30770  Fungal transcriptional regulatory protein  28.84 
 
 		 759 aa  92.8  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00132045  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28000  Fungal-specific transcription factor  24.26 
 
 		 858 aa  87  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395949  normal  0.0721946 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29444  Fungal specific transcription factor  22.61 
 
 		 1135 aa  82  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88209  Fungal specific transcription factor  22.79 
 
 		 1028 aa  73.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0520649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76670  Fungal transcriptional regulatory protein  21.09 
 
 		 1026 aa  68.2  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31115  zinc finger transcription factor  23.08 
 
 		 765 aa  61.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58009  Fungal transcriptional regulatory protein  51.22 
 
 		 1047 aa  57.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.513512  normal  0.0535661 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32517  predicted protein  54.55 
 
 		 617 aa  57.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.475893  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01820  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  42.37 
 
 		 1030 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11793  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  42.37 
 
 		 541 aa  52.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.617651  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01518  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  53.66 
 
 		 825 aa  52  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650204  normal  0.31742 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57167  Fungal specific transcription factor  51.22 
 
 		 713 aa  51.2  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.256805  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06396  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  40 
 
 		 772 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00359431  normal  0.0434138 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10105  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  45.45 
 
 		 1119 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03820  expressed protein  47.62 
 
 		 737 aa  50.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65252  putative transcriptional regulatory protein  48.78 
 
 		 674 aa  50.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.361708 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05052  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  50 
 
 		 715 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000607074  hitchhiker  0.0000000000000818279 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00718  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  46.34 
 
 		 636 aa  48.5  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.720947 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08894  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  50 
 
 		 871 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37775  Fungal transcriptional regulatory protein  42.11 
 
 		 937 aa  48.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.709365  normal  0.204154 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03650  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  40.54 
 
 		 815 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.653785 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10128  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  47.62 
 
 		 1065 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0112163  normal  0.804526 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01134  Quinic acid utilization activator [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10563]  39.53 
 
 		 825 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.524826  normal  0.226407 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02615  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  43.18 
 
 		 682 aa  46.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_13001  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  43.18 
 
 		 614 aa  45.8  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102904  normal  0.339572 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06293  acuM, Zn(II)2Cys6 transcription factor involved in transcription control of gluconeogenisis (Eurofung)  32.05 
 
 		 522 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07971  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.03 
 
 		 665 aa  45.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.145965 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01029  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  29.87 
 
 		 666 aa  44.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608313  normal  0.472305 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03750  hypothetical protein  35.09 
 
 		 563 aa  44.7  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.863071  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03750  hypothetical protein  35.09 
 
 		 563 aa  44.7  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>