52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_76670 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_76670  Fungal transcriptional regulatory protein  100 
 
 
1026 aa  2125    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82123  Fungal transcriptional regulatory protein  33.39 
 
 
1080 aa  541  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.600944 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88209  Fungal specific transcription factor  36.26 
 
 
1028 aa  478  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0520649  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81861  Fungal transcriptional regulatory protein  30.91 
 
 
1095 aa  420  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518071  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56468  Fungal transcriptional regulatory protein  32.74 
 
 
876 aa  402  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753603  normal  0.102552 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_935  Fungal transcriptional regulatory protein  31.83 
 
 
760 aa  340  7e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.664373 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30770  Fungal transcriptional regulatory protein  30.53 
 
 
759 aa  264  6e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00132045  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29444  Fungal specific transcription factor  26.17 
 
 
1135 aa  225  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53992  CYP1/HAP1-like protein  24.53 
 
 
758 aa  211  4e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31115  zinc finger transcription factor  28.02 
 
 
765 aa  205  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28000  Fungal-specific transcription factor  25.81 
 
 
858 aa  197  6e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395949  normal  0.0721946 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56968  positive regulator of cytochrome C genes CYC1 and CYC7  22.14 
 
 
1085 aa  78.2  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.489386 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07189  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  26.71 
 
 
697 aa  55.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37775  Fungal transcriptional regulatory protein  46 
 
 
937 aa  54.7  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.709365  normal  0.204154 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02852  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  42.55 
 
 
1018 aa  54.3  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_1028  Fungal Zn2Cys6 Cluster domain  52.38 
 
 
868 aa  52.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.580079 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07163  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  33.33 
 
 
739 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946609  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60634  STB4; binds Sin3p in two-hybrid assay  47.62 
 
 
742 aa  51.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.279856  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08918  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  37.29 
 
 
618 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.826672 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08355  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  34.02 
 
 
526 aa  49.7  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77168  transcriptional regulator  46.34 
 
 
907 aa  49.7  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11003  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  31.53 
 
 
847 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.824231  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01729  PrnA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42805]  42.55 
 
 
818 aa  48.9  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678947  normal  0.0956795 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10541  fungal specific transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06190)  25.6 
 
 
729 aa  48.1  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01518  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.07 
 
 
825 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650204  normal  0.31742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11185  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  32 
 
 
779 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.298239 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06396  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  32.63 
 
 
772 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00359431  normal  0.0434138 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06430  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  23.53 
 
 
746 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0018696  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03835  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  35.48 
 
 
594 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.821404  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02826  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  30.3 
 
 
396 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.106742 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10979  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.43 
 
 
673 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.697812  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04118  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  50 
 
 
559 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05849  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  40.91 
 
 
1077 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.14786  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11818  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  25.66 
 
 
437 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.404079 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01134  Quinic acid utilization activator [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10563]  46.51 
 
 
825 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.524826  normal  0.226407 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10897  conserved hypothetical protein  34.88 
 
 
614 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.489367  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07971  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  40 
 
 
665 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.145965 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00110  conserved hypothetical protein  30.59 
 
 
803 aa  45.8  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.064072  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47398  zinc finger transcription factor of the Zn(2)-Cys(6) binuclear cluster domain type  42.86 
 
 
800 aa  45.8  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.654245  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06091  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  48.72 
 
 
734 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0514729 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10638  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  33.33 
 
 
759 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0597746  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01303  ScfA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1WD27]  48.28 
 
 
729 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467312  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03190  nucleus protein, putative  30.86 
 
 
1060 aa  45.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07050  FarA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1WD26]  37.14 
 
 
939 aa  45.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.955332  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04837  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  35.82 
 
 
684 aa  45.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355797  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58009  Fungal transcriptional regulatory protein  48.84 
 
 
1047 aa  44.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.513512  normal  0.0535661 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07610  Putative transcription factor [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J128]  36.36 
 
 
875 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31755  predicted protein  40 
 
 
1086 aa  44.7  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.115021 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00619  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  43.24 
 
 
762 aa  44.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66925  predicted protein  34.29 
 
 
1062 aa  44.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07332  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.38 
 
 
745 aa  44.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  25.53 
 
 
959 aa  44.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>