45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56468 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_56468  Fungal transcriptional regulatory protein  100 
 
 
876 aa  1814    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753603  normal  0.102552 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88209  Fungal specific transcription factor  34.98 
 
 
1028 aa  490  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0520649  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82123  Fungal transcriptional regulatory protein  35.6 
 
 
1080 aa  463  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.600944 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76670  Fungal transcriptional regulatory protein  32.83 
 
 
1026 aa  398  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81861  Fungal transcriptional regulatory protein  31.15 
 
 
1095 aa  362  1e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518071  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_935  Fungal transcriptional regulatory protein  29.69 
 
 
760 aa  355  2e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.664373 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30770  Fungal transcriptional regulatory protein  28.21 
 
 
759 aa  281  4e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00132045  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28000  Fungal-specific transcription factor  27.72 
 
 
858 aa  239  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395949  normal  0.0721946 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53992  CYP1/HAP1-like protein  24.66 
 
 
758 aa  231  4e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29444  Fungal specific transcription factor  25.09 
 
 
1135 aa  209  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31115  zinc finger transcription factor  26.43 
 
 
765 aa  160  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56968  positive regulator of cytochrome C genes CYC1 and CYC7  24.41 
 
 
1085 aa  107  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.489386 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58009  Fungal transcriptional regulatory protein  28.22 
 
 
1047 aa  64.7  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.513512  normal  0.0535661 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06430  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  29.71 
 
 
746 aa  60.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0018696  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07332  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.18 
 
 
745 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01518  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  46.94 
 
 
825 aa  55.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650204  normal  0.31742 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08355  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  26.95 
 
 
526 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10638  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.38 
 
 
759 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0597746  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01820  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  36.76 
 
 
1030 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11793  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  37.29 
 
 
541 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.617651  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02030  nucleus protein, putative  22.97 
 
 
1012 aa  51.2  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.614531  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06091  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  43.9 
 
 
734 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0514729 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08125  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.86 
 
 
832 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.350651 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08894  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.03 
 
 
871 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487487  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11003  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.68 
 
 
847 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.824231  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07971  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  43.59 
 
 
665 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.145965 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08414  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  36.92 
 
 
730 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.849595 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47398  zinc finger transcription factor of the Zn(2)-Cys(6) binuclear cluster domain type  53.85 
 
 
800 aa  48.5  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.654245  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01641  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  27.62 
 
 
681 aa  48.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293594  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08441  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  30.53 
 
 
749 aa  48.1  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.739366  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03860  nucleus protein, putative  35.9 
 
 
1043 aa  47.8  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01550  hypothetical protein  42.86 
 
 
684 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10504  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  24.75 
 
 
811 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.141507  normal  0.456336 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03050  Putative Zn(II)2Cys6 transcription facto (Eurofung)  28.71 
 
 
804 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.328433 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03684  C6 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12570)  26.21 
 
 
624 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02852  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  37.29 
 
 
1018 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02070  expressed protein  35.42 
 
 
627 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.273146  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00840  hypothetical protein  36.84 
 
 
1027 aa  45.8  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05990  fungal Zn(2)-Cys(6) binuclear cluster domain-containing protein, putative  28.26 
 
 
852 aa  45.8  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07163  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  35.71 
 
 
739 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946609  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01410  expressed protein  25 
 
 
667 aa  45.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08111  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  19.66 
 
 
753 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30732 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02016  AmyR proteinAmylase cluster transcriptional regulator AmyRPutative uncharacterized protein ;; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y728]  50 
 
 
662 aa  44.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00480  expressed protein  23.76 
 
 
864 aa  44.3  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.42245  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06293  acuM, Zn(II)2Cys6 transcription factor involved in transcription control of gluconeogenisis (Eurofung)  31.34 
 
 
522 aa  44.3  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>