40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29444 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_29444  Fungal specific transcription factor  100 
 
 
1135 aa  2368    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82123  Fungal transcriptional regulatory protein  27.79 
 
 
1080 aa  276  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.600944 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_935  Fungal transcriptional regulatory protein  27.47 
 
 
760 aa  221  5e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.664373 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76670  Fungal transcriptional regulatory protein  26.02 
 
 
1026 aa  206  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88209  Fungal specific transcription factor  28.73 
 
 
1028 aa  204  8e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0520649  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56468  Fungal transcriptional regulatory protein  25.09 
 
 
876 aa  186  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.753603  normal  0.102552 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81861  Fungal transcriptional regulatory protein  29.17 
 
 
1095 aa  181  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.518071  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30770  Fungal transcriptional regulatory protein  26.15 
 
 
759 aa  144  9e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00132045  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28000  Fungal-specific transcription factor  25.43 
 
 
858 aa  135  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395949  normal  0.0721946 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53992  CYP1/HAP1-like protein  24.95 
 
 
758 aa  133  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31115  zinc finger transcription factor  26.62 
 
 
765 aa  107  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56968  positive regulator of cytochrome C genes CYC1 and CYC7  26.02 
 
 
1085 aa  81.6  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.489386 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01518  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  52.5 
 
 
825 aa  58.9  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650204  normal  0.31742 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07332  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  34.85 
 
 
745 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33076  predicted protein  43.48 
 
 
648 aa  52  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.759857  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10638  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  44.19 
 
 
759 aa  52  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0597746  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47398  zinc finger transcription factor of the Zn(2)-Cys(6) binuclear cluster domain type  47.73 
 
 
800 aa  51.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.654245  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07971  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  30.26 
 
 
665 aa  49.7  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.145965 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08894  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  42.22 
 
 
871 aa  49.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.487487  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58009  Fungal transcriptional regulatory protein  48.78 
 
 
1047 aa  48.5  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.513512  normal  0.0535661 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00840  hypothetical protein  29.76 
 
 
1027 aa  48.1  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02016  AmyR proteinAmylase cluster transcriptional regulator AmyRPutative uncharacterized protein ;; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y728]  30.68 
 
 
662 aa  48.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08079  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  37.5 
 
 
680 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0152693  normal  0.153171 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08125  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.26 
 
 
832 aa  48.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.350651 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00619  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  42.86 
 
 
762 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03190  nucleus protein, putative  35.42 
 
 
1060 aa  47.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08177  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  31.19 
 
 
867 aa  47.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.681278  normal  0.988868 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01410  expressed protein  27.64 
 
 
667 aa  47.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01303  ScfA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1WD27]  23.87 
 
 
729 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.467312  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02780  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  43.24 
 
 
638 aa  45.8  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640592  normal  0.867713 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10541  fungal specific transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06190)  58.62 
 
 
729 aa  45.8  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06430  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  25.5 
 
 
746 aa  45.8  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0018696  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10105  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  46.67 
 
 
1119 aa  45.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227022  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08441  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  28.41 
 
 
749 aa  45.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.739366  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91238  predicted protein  31 
 
 
894 aa  45.4  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.393184  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00480  expressed protein  36.84 
 
 
864 aa  45.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.42245  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02852  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  41.67 
 
 
1018 aa  45.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02820  nucleus protein, putative  44.74 
 
 
1138 aa  45.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.230984  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02030  nucleus protein, putative  34.88 
 
 
1012 aa  44.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.614531  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30024  predicted protein  32.31 
 
 
756 aa  44.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>