24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66478 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_66478  predicted protein  100 
 
 		 1562 aa  3191    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05787  Rho GTPase activator (Bem3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06400)  34.58 
 
 		 1411 aa  157  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02560  signal transducer, putative  29.64 
 
 		 1151 aa  121  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06490  Rho GTPase activator, putative  32.79 
 
 		 906 aa  108  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04745  hypothetical protein similar to Rho GTPase activating protein (Eurofung)  31.53 
 
 		 665 aa  79.7  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.993883  normal  0.20139 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01025  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  25.84 
 
 		 1067 aa  75.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03746  Rho GTPase activator (Bem2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04450)  24.86 
 
 		 625 aa  75.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01350  GTPase activating protein, putative  31.14 
 
 		 806 aa  75.5  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749698  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03540  signal transducer, putative  29.94 
 
 		 732 aa  66.6  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66424  Rho-type GTPase-activating protein  26.92 
 
 		 1191 aa  64.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03250  Rho GTPase activator, putative  24.1 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3250  CG2839  23.28 
 
 		 231 aa  57.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3763  hypothetical protein  24.09 
 
 		 219 aa  57.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91378  GTPase activating protein (GAP) for RHO  35.71 
 
 		 644 aa  56.2  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.962862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02770  glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, putative  24.1 
 
 		 1100 aa  56.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74324  predicted protein  29.38 
 
 		 1119 aa  55.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000849527 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66353  cortical Rho GTPase activating protein  26.32 
 
 		 591 aa  54.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.287043 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07650  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  36.9 
 
 		 1236 aa  52.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00375231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.56 
 
 		 364 aa  50.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 317 aa  50.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06260  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 		 810 aa  48.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.272124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  28.57 
 
 		 334 aa  47.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  29.55 
 
 		 925 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  26.42 
 
 		 518 aa  46.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>