14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_91378 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_91378  GTPase activating protein (GAP) for RHO  100 
 
 		 644 aa  1305    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.962862  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07650  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  53.06 
 
 		 1236 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00375231  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03250  Rho GTPase activator, putative  46.56 
 
 		 464 aa  134  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66424  Rho-type GTPase-activating protein  30.43 
 
 		 1191 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74324  predicted protein  32.21 
 
 		 1119 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000849527 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66478  predicted protein  35.71 
 
 		 1562 aa  55.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05787  Rho GTPase activator (Bem3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06400)  31.9 
 
 		 1411 aa  53.9  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66353  cortical Rho GTPase activating protein  31.43 
 
 		 591 aa  53.9  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03540  signal transducer, putative  26.79 
 
 		 732 aa  48.9  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04745  hypothetical protein similar to Rho GTPase activating protein (Eurofung)  27.78 
 
 		 665 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.993883  normal  0.20139 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02770  glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, putative  33.33 
 
 		 1100 aa  47.4  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03746  Rho GTPase activator (Bem2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04450)  30.26 
 
 		 625 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01025  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  28.4 
 
 		 1067 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01350  GTPase activating protein, putative  26.67 
 
 		 806 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>