22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66424 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_66424  Rho-type GTPase-activating protein  100 
 
 		 1191 aa  2462    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01025  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  58.33 
 
 		 1067 aa  197  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04745  hypothetical protein similar to Rho GTPase activating protein (Eurofung)  30.99 
 
 		 665 aa  111  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.993883  normal  0.20139 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01350  GTPase activating protein, putative  32.8 
 
 		 806 aa  110  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749698  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03540  signal transducer, putative  32.02 
 
 		 732 aa  109  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02560  signal transducer, putative  26.97 
 
 		 1151 aa  89.7  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66353  cortical Rho GTPase activating protein  29.44 
 
 		 591 aa  88.2  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.287043 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05787  Rho GTPase activator (Bem3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06400)  29.38 
 
 		 1411 aa  84  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02770  glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, putative  26.42 
 
 		 1100 aa  78.2  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03746  Rho GTPase activator (Bem2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04450)  25.39 
 
 		 625 aa  74.3  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74324  predicted protein  26.38 
 
 		 1119 aa  68.2  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000849527 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03250  Rho GTPase activator, putative  22.05 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66478  predicted protein  26.92 
 
 		 1562 aa  65.1  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07650  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  26.47 
 
 		 1236 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00375231  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06490  Rho GTPase activator, putative  30.43 
 
 		 906 aa  63.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44196  bud-emergence protein  27.57 
 
 		 1747 aa  61.6  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91378  GTPase activating protein (GAP) for RHO  30.43 
 
 		 644 aa  60.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.962862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02710  Rho GTPase activator, putative  25.9 
 
 		 1296 aa  58.9  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06260  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 		 810 aa  56.6  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.272124  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03659  conserved hypothetical protein similar to paxillins (Eurofung)  31.03 
 
 		 776 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07576  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  27.15 
 
 		 1201 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.230213  normal  0.583804 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60893  predicted protein  24.29 
 
 		 883 aa  45.4  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.319256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>