21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01350 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF01350  GTPase activating protein, putative  100 
 
 		 806 aa  1672    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749698  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04745  hypothetical protein similar to Rho GTPase activating protein (Eurofung)  29.96 
 
 		 665 aa  280  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.993883  normal  0.20139 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66353  cortical Rho GTPase activating protein  33.82 
 
 		 591 aa  124  9e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.287043 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01025  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  26.85 
 
 		 1067 aa  124  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03540  signal transducer, putative  33.94 
 
 		 732 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66424  Rho-type GTPase-activating protein  32.8 
 
 		 1191 aa  110  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02560  signal transducer, putative  35.29 
 
 		 1151 aa  102  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05787  Rho GTPase activator (Bem3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06400)  28.22 
 
 		 1411 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02770  glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, putative  32.03 
 
 		 1100 aa  83.2  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02710  Rho GTPase activator, putative  33.54 
 
 		 1296 aa  77  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66478  predicted protein  31.14 
 
 		 1562 aa  75.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44196  bud-emergence protein  29.9 
 
 		 1747 aa  73.6  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06490  Rho GTPase activator, putative  26.42 
 
 		 906 aa  69.3  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74324  predicted protein  26.52 
 
 		 1119 aa  63.9  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000849527 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07576  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  24.84 
 
 		 1201 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.230213  normal  0.583804 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03746  Rho GTPase activator (Bem2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04450)  25.33 
 
 		 625 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06260  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 		 810 aa  57.4  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.272124  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07650  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  23.83 
 
 		 1236 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00375231  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03250  Rho GTPase activator, putative  22.42 
 
 		 464 aa  48.1  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33314  predicted protein  24.56 
 
 		 880 aa  46.2  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.137938  normal  0.0154769 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91378  GTPase activating protein (GAP) for RHO  26.67 
 
 		 644 aa  45.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.962862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>