88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28993 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_28993  Peroxisomal membrane protein PMP47  100 
 
 
334 aa  664    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.629442  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04280  peroxisomal membrane protein Pmp47, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04310)  44.05 
 
 
320 aa  249  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.818719 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03310  peroxisomal membrane protein, putative  38.4 
 
 
323 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43906  MC family transporter: peroxisomal membrane protein  25.38 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0187062 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3755  predicted protein  29.27 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00257  peroxisomal carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03440)  27.96 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0142287 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54260  ADP/ATP carrier protein  28.48 
 
 
350 aa  110  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45267  mitochondrial carrier protein  25.85 
 
 
375 aa  98.6  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0835876  normal  0.824386 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13538  predicted protein  26.21 
 
 
299 aa  94  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04080  mitochondrial carrier protein rim2, putative  25.27 
 
 
410 aa  92  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5879  MC family transporter: folate  23.77 
 
 
313 aa  89  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00521533 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_6022  MC family transporter: folate  23.77 
 
 
313 aa  89  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.26277  hitchhiker  0.00241636 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83067  predicted protein  25.4 
 
 
363 aa  86.7  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00421755  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10823  mitochondrial folate carrier protein Flx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05170)  25.23 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.793163 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05269  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.260749  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17914  predicted protein  25.24 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0969032  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08040  transporter, putative  25.91 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04480  hypothetical protein  26.61 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13728  MC family transporter: peroxisomal membrane protein  33.33 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.874892  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57133  Mitochondrial FAD carrier protein  21.71 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.240941 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04387  mitochondrial carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06780)  21.74 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00346  mitochondrial carrier protein (Rim2), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06950)  25.89 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33920  MC family transporter: adenylate (Brittle-1 protein)  27.27 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.39861 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23723  predicted protein  22.98 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02220  adenine nucleotide transporter, putative  40.4 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.395188  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11083  predicted protein  21.94 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.492894  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04160  flavin-adenine dinucleotide transporter, putative  26.75 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347203  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44261  MC family transporter: folate  24.63 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.426414 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10303  mitochondrial carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13870)  25.31 
 
 
461 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.511173 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01580  tricarboxylate transport protein (ctp), putative  20.92 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.721569  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23709  predicted protein  23.49 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00469495  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60941  mitochondrial thiamine pyrophosphate transporter  25.37 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.86115  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16210  predicted protein  24.58 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23053  predicted protein  23.69 
 
 
363 aa  67  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0125562  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29031  citrate transport protein  24.27 
 
 
294 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0488853  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12405  predicted protein  24.52 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390434  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08785  mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  21.89 
 
 
707 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.554157 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31296  mitochondrial ADP/ATP carrier protein  26.79 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.830812  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44281  MC family transporter: 2-oxodicarboxylate  27.23 
 
 
285 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02570  succinate:fumarate antiporter, putative  21.45 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38298  MC family transporter  25 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.28275  normal  0.454527 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05801  mitochondrial carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07400)  22.26 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000290975 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60344  mitochondrial succinate-fumarate transporter  23.51 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0581106  normal  0.0668593 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06530  carnitine/acyl carnitine carrier, putative  26.37 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17794  predicted protein  27.42 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.234144  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88774  MC family transporter: succinate/fumarate  25.88 
 
 
324 aa  57  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07569  Mitochondrial thiamine pyrophosphate carrier 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AVW1]  25.51 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0176662  normal  0.34397 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66382  membrane transporter, Mitochondrial Carrier Family  23.81 
 
 
388 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01917  hypothetical protein similar to mitochondrial dicarboxylate/tricarboxylate transporter (Eurofung)  24.45 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0895332 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16237  MC family transporter: succinate/fumarate  29.77 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.200123  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42609  predicted protein  22.73 
 
 
383 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.764746  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66704  Mitochondrial aspartate/glutamate carrier protein Aralar/Citrin (contains EF-hand Ca2+-binding domains)  23.08 
 
 
721 aa  53.1  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186703  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15797  predicted protein  24.86 
 
 
303 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23532  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04064  ADP,ATP carrier protein (Broad)  22.89 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.610011  normal  0.036768 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5140  MC family transporter: deoxynucleotide  26.4 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.568783 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_5273  MC family transporter: deoxynucleotide  26.4 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.23541  hitchhiker  0.00289119 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34060  MC family transporter: aspartate/glutamate (Ca2+-activated)  19.7 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18489  predicted protein  30.07 
 
 
286 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0358222  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23908  predicted protein  23.58 
 
 
312 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35949  predicted protein  25.5 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01090  conserved hypothetical protein  22.36 
 
 
319 aa  50.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_5175  predicted protein  25.41 
 
 
264 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26689  MC family transporter: adenylate  26.79 
 
 
308 aa  49.3  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.135976  decreased coverage  0.00357387 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13752  predicted protein  24.49 
 
 
248 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.172433  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85436  ADP,ATP carrier protein  20.11 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01080  ATP:ADP antiporter, putative  22.36 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423036  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06254  hypothetical protein similar to mitochondrial dicarboxylate transporter (Eurofung)  25.33 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324281  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00066  mitochondrial oxaloacetate transporter (Oac), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12360)  24.78 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.648133 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10172  mitochondrial 2-oxodicarboxylate carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09660)  28.46 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0644705  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24002  MC family transporter: aspartate/glutamate (Ca2+-activated)  20.1 
 
 
421 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32017  Mitochondrial carnitine carrier  23.76 
 
 
284 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0367083  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22873  predicted protein  22.12 
 
 
303 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12788  predicted protein  21.98 
 
 
229 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07287  Mitochondrial succinate-fumarate antiporter (Eurofung)  23.05 
 
 
323 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0532227  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17060  MC family transporter: ADP/ATP  23.9 
 
 
299 aa  46.2  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00115908  normal  0.170706 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36045  MC family transporter: carnitine/acylcarnitine  22.12 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.400075  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16286  predicted protein  20.39 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13856  predicted protein  24.59 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.168229  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02540  organic acid transporter, putative  28.57 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76093  predicted protein  25.2 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.146837  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45104  major mitochondrial ADP/ATP translocator  20.95 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.32361 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02690  mitochondrial inner membrane protein, putative  24.12 
 
 
698 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02173  calcium-dependent mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  23 
 
 
580 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00497794  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04250  mitochondrial carrier protein (Ymc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06530)  23.77 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08881  Mitochondrial carrier AMCAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1Z8]  20.46 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.118695  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07304  mitochondrial carrier protein (Leu5), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16770)  21.28 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111341  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78946  mitochondrial dicarboxylate transport protein  25 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.170378  normal  0.239614 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5965  MC family transporter: Grave's disease carrier protein (GDC)-like protein  24.18 
 
 
294 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00911684  normal  0.0176051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>