28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46903 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46903  predicted protein  100 
 
 
682 aa  1410    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31010  predicted protein  30.07 
 
 
291 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28852  predicted protein  27.76 
 
 
299 aa  94.7  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01467  conserved hypothetical protein  30.51 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00677461 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83421  predicted protein  24.21 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30844  predicted protein  30.81 
 
 
428 aa  65.1  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0384942 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10064  conserved hypothetical protein  22.01 
 
 
399 aa  57.8  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.248577  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00560  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 
378 aa  55.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.14551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.15 
 
 
504 aa  51.6  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.94 
 
 
503 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 
625 aa  49.7  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  32.99 
 
 
164 aa  49.7  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.93 
 
 
482 aa  47  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.93 
 
 
482 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  28.07 
 
 
513 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.34 
 
 
483 aa  46.6  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.34 
 
 
147 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  28.57 
 
 
146 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  29.52 
 
 
139 aa  45.8  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.83 
 
 
476 aa  45.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  27.01 
 
 
493 aa  45.4  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.37 
 
 
504 aa  45.8  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  31.67 
 
 
269 aa  45.4  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  28.07 
 
 
513 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  28.1 
 
 
384 aa  44.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  41.3 
 
 
493 aa  44.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.38 
 
 
487 aa  44.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 
171 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>