16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83421 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_83421  predicted protein  100 
 
 
366 aa  754    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01467  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 
450 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00677461 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00560  conserved hypothetical protein  29.96 
 
 
378 aa  109  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.14551  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28852  predicted protein  29.85 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11459  predicted protein  28.03 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.474457  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30844  predicted protein  27.11 
 
 
428 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0384942 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31010  predicted protein  26.64 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31223  predicted protein  24.66 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.611184 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46903  predicted protein  24.21 
 
 
682 aa  70.5  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  28.75 
 
 
245 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03270  hypothetical protein  32.17 
 
 
675 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10064  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.248577  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.41 
 
 
238 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  28.24 
 
 
422 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  23.96 
 
 
261 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  24.56 
 
 
236 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>