More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49415 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49415  predicted protein  100 
 
 		 586 aa  1220    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42902  predicted protein  35.51 
 
 		 1343 aa  289  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  31.98 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  31.38 
 
 		 436 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  31.57 
 
 		 436 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  30.96 
 
 		 437 aa  203  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.26 
 
 		 519 aa  200  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  30.12 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  28.75 
 
 		 394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.92 
 
 		 446 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.52 
 
 		 446 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.72 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  29.72 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.72 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  26.67 
 
 		 401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  28.05 
 
 		 399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  27.27 
 
 		 399 aa  183  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3393  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  27.24 
 
 		 399 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0189919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2216  cobalamin synthesis protein P47K  28.65 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  29.18 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  29.18 
 
 		 437 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  29.18 
 
 		 437 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  27.31 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  27.11 
 
 		 406 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  27.22 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  27.36 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  27.59 
 
 		 401 aa  171  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  27.63 
 
 		 401 aa  170  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  28.42 
 
 		 406 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0422  cobalamin synthesis protein P47K  27.31 
 
 		 442 aa  169  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  26.4 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  27.05 
 
 		 404 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  27.22 
 
 		 407 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  26.34 
 
 		 407 aa  163  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  25.57 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2119  cobalamin synthesis protein P47K  26.18 
 
 		 393 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  26.16 
 
 		 441 aa  161  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  26.8 
 
 		 416 aa  160  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  25.93 
 
 		 405 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6411  cobalamin synthesis protein P47K  27.84 
 
 		 394 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352865  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00170  cobalamin synthesis protein, putative  25.43 
 
 		 563 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.488231  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  24.95 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  26.88 
 
 		 410 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0846  cobalamin synthesis protein P47K  26.24 
 
 		 449 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.256536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1955  cobalamin synthesis protein P47K  27.47 
 
 		 392 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  26.06 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  26.69 
 
 		 401 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10344  CobW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02620)  24.82 
 
 		 528 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000558186  normal  0.183792 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  24.38 
 
 		 403 aa  151  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  25.91 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.4 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.4 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  25.97 
 
 		 402 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  24.9 
 
 		 401 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  37 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  33.58 
 
 		 395 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  33.58 
 
 		 379 aa  144  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1446  cobalamin synthesis protein P47K  36.89 
 
 		 403 aa  144  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.454825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  37.27 
 
 		 356 aa  143  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  33.98 
 
 		 404 aa  143  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  36 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  33.21 
 
 		 372 aa  141  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  33.75 
 
 		 417 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  37.66 
 
 		 435 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 		 438 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  36 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  33.05 
 
 		 406 aa  140  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  32.84 
 
 		 527 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  32.84 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  32.84 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  33.21 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6409  cobalamin synthesis protein P47K  34.96 
 
 		 410 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  32.62 
 
 		 423 aa  139  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  34.65 
 
 		 408 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  35.53 
 
 		 400 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  36 
 
 		 395 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  37.23 
 
 		 435 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  34.21 
 
 		 423 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  36.91 
 
 		 352 aa  137  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  34.21 
 
 		 422 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5361  CobW/P47K family protein  33.78 
 
 		 402 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  35.09 
 
 		 400 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  35.09 
 
 		 400 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  33.77 
 
 		 423 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  33.77 
 
 		 402 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  33.77 
 
 		 423 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  32.94 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  24.02 
 
 		 376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  33.78 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  32.89 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 401 aa  135  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  33.04 
 
 		 406 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0045  hypothetical protein  36.44 
 
 		 424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1098  cobalamin synthesis protein P47K  33.19 
 
 		 397 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118986 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  32.74 
 
 		 442 aa  134  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  32.75 
 
 		 540 aa  134  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  32.74 
 
 		 442 aa  133  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 402 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>