More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48414 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48414  predicted protein  100 
 
 
593 aa  1232    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0500715  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16744  predicted protein  31.05 
 
 
486 aa  193  7e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.544898  normal  0.122901 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71737  predicted protein  28.52 
 
 
537 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.940681  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03840  FPGS, folylpolyglutamate synthase (Eurofung)  29.89 
 
 
517 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04840  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase, putative  39.41 
 
 
497 aa  145  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  28.08 
 
 
453 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  29.9 
 
 
429 aa  137  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  26.79 
 
 
447 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  32.2 
 
 
485 aa  131  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  30.49 
 
 
434 aa  126  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  28.28 
 
 
424 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  43.09 
 
 
471 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  43.1 
 
 
450 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  33.14 
 
 
461 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  29.95 
 
 
543 aa  123  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1604  FolC bifunctional protein  28.11 
 
 
501 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  28.74 
 
 
437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  36.45 
 
 
443 aa  120  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  29.97 
 
 
459 aa  120  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.47 
 
 
466 aa  120  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  25.84 
 
 
432 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  27.87 
 
 
431 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  28.79 
 
 
454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  35.96 
 
 
465 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  42.13 
 
 
468 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  27.14 
 
 
435 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  38.94 
 
 
408 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  42.13 
 
 
440 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  27.58 
 
 
466 aa  117  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  39.11 
 
 
428 aa  117  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  29.22 
 
 
463 aa  117  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  27.15 
 
 
428 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  39.11 
 
 
428 aa  116  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  28.21 
 
 
424 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  28 
 
 
431 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  26.79 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  36.78 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  39.66 
 
 
433 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  41.18 
 
 
422 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  40.76 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  29.9 
 
 
878 aa  114  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  35.26 
 
 
435 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  39.08 
 
 
438 aa  114  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.57 
 
 
427 aa  114  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  36.49 
 
 
426 aa  114  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  30.32 
 
 
428 aa  114  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  29.88 
 
 
452 aa  114  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  28.54 
 
 
847 aa  113  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  35.79 
 
 
436 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  41.14 
 
 
429 aa  113  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  39.88 
 
 
442 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  35.79 
 
 
435 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  29.25 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  30.1 
 
 
810 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.73 
 
 
434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  35.05 
 
 
404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.73 
 
 
434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.73 
 
 
434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.66 
 
 
464 aa  112  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  29.2 
 
 
451 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  33.95 
 
 
425 aa  111  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  25.64 
 
 
429 aa  112  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  27.48 
 
 
431 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  30.32 
 
 
508 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  32.55 
 
 
428 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.68 
 
 
470 aa  111  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  39.08 
 
 
526 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  30.23 
 
 
813 aa  110  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  24.71 
 
 
434 aa  110  6e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.15 
 
 
422 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  39.88 
 
 
515 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  27.64 
 
 
441 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  35.89 
 
 
434 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  35.87 
 
 
423 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  35.87 
 
 
423 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.41 
 
 
422 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  35.87 
 
 
423 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  35.87 
 
 
423 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  37.79 
 
 
421 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1084  folylpolyglutamate synthetase, putative  37.72 
 
 
450 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  35.08 
 
 
431 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  39.38 
 
 
408 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  28.18 
 
 
437 aa  109  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  28.18 
 
 
435 aa  109  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  33.49 
 
 
435 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  31.02 
 
 
424 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  34.88 
 
 
448 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  31.32 
 
 
817 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  36.96 
 
 
423 aa  107  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  38.29 
 
 
418 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  26.72 
 
 
441 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  35.5 
 
 
432 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  39.66 
 
 
452 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  28.15 
 
 
462 aa  107  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  27.91 
 
 
438 aa  107  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  38.66 
 
 
425 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.88 
 
 
422 aa  107  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  35.07 
 
 
443 aa  107  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  35.5 
 
 
432 aa  107  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0758  FolC bifunctional protein  39.64 
 
 
451 aa  106  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000171219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>