17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43655 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43655  predicted protein  100 
 
 
491 aa  1000    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  35.44 
 
 
712 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41450  predicted protein  29.82 
 
 
175 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.492829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.72 
 
 
1711 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.36 
 
 
828 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  32.58 
 
 
1304 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  37.88 
 
 
485 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_539  predicted protein  34.25 
 
 
719 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.611801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  36.49 
 
 
405 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  33.78 
 
 
1190 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  33.75 
 
 
1188 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.76 
 
 
675 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.45 
 
 
1164 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  26.19 
 
 
511 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  34.72 
 
 
1196 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  32 
 
 
1661 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  31.18 
 
 
504 aa  43.5  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>