23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15563 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_15563  predicted protein  100 
 
 
224 aa  464  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7767  predicted protein  53.8 
 
 
190 aa  190  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8327  predicted protein  45.75 
 
 
165 aa  135  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.989664 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03650  protein phosphatase, putative  43.14 
 
 
613 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.382354  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8658  predicted protein  43.71 
 
 
195 aa  134  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81784  predicted protein  40.37 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.983288  normal  0.991644 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10077  protein phosphatase (Eurofung)  43.29 
 
 
560 aa  128  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00228597  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01343  NIF domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09460)  36.65 
 
 
515 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000375841  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03030  nuclear envelope-endoplasmic reticulum network protein, putative  31.38 
 
 
1305 aa  96.7  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14327  predicted protein  35.94 
 
 
199 aa  95.9  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52759  mitochondrial inner membrane protein required for protein import  31.46 
 
 
471 aa  85.1  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.581511 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05150  mitochondrial matrix protein import-related protein, putative  30.91 
 
 
516 aa  82.8  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64901  Nuclear Envelope Morphology  29.25 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34411  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim50  32.73 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00066081  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04490  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim50 Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4P0]  32.05 
 
 
532 aa  77  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00295759  normal  0.0269512 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3171  predicted protein  32.96 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248181  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02902  CTD phosphatase-related (Eurofung)  31.78 
 
 
829 aa  52  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63097  predicted protein  27.89 
 
 
790 aa  48.9  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6261  predicted protein  24.03 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5701  NLI interacting domain protein  26.99 
 
 
188 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42478  predicted protein  32.22 
 
 
809 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04270  protein phosphatase, putative  33.33 
 
 
955 aa  42  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.520699  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31186  predicted protein  26.17 
 
 
643 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00225815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>