18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5701 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5701  NLI interacting domain protein  100 
 
 		 188 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8658  predicted protein  28.42 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03650  protein phosphatase, putative  27.84 
 
 		 613 aa  74.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.382354  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64901  Nuclear Envelope Morphology  29.38 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8327  predicted protein  27.38 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.989664 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15563  predicted protein  28.99 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01343  NIF domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09460)  26.18 
 
 		 515 aa  55.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000375841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14327  predicted protein  21.81 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81784  predicted protein  27.16 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.983288  normal  0.991644 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_7101  predicted protein  27.96 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03030  nuclear envelope-endoplasmic reticulum network protein, putative  23.61 
 
 		 1305 aa  53.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7767  predicted protein  25.29 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3171  predicted protein  25.95 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248181  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31529  predicted protein  26.42 
 
 		 346 aa  49.3  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10077  protein phosphatase (Eurofung)  25.88 
 
 		 560 aa  45.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00228597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52759  mitochondrial inner membrane protein required for protein import  25.9 
 
 		 471 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.581511 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02902  CTD phosphatase-related (Eurofung)  24.21 
 
 		 829 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.150265 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04490  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim50 Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4P0]  21.55 
 
 		 532 aa  42  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00295759  normal  0.0269512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>