16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52759 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_52759  mitochondrial inner membrane protein required for protein import  100 
 
 
471 aa  971    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.581511 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04490  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim50 Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4P0]  44.01 
 
 
532 aa  273  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00295759  normal  0.0269512 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05150  mitochondrial matrix protein import-related protein, putative  35.09 
 
 
516 aa  209  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34411  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim50  40.09 
 
 
237 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00066081  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3171  predicted protein  37.56 
 
 
220 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248181  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7767  predicted protein  35.39 
 
 
190 aa  110  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03650  protein phosphatase, putative  36.46 
 
 
613 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.382354  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8658  predicted protein  36.46 
 
 
195 aa  100  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10077  protein phosphatase (Eurofung)  31.89 
 
 
560 aa  93.6  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00228597  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81784  predicted protein  31.74 
 
 
171 aa  88.6  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.983288  normal  0.991644 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15563  predicted protein  31.46 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01343  NIF domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09460)  34.65 
 
 
515 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000375841  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8327  predicted protein  34.19 
 
 
165 aa  76.6  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.989664 
 
 
-
 
NC_006686  CND03030  nuclear envelope-endoplasmic reticulum network protein, putative  30.82 
 
 
1305 aa  65.1  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14327  predicted protein  32.09 
 
 
199 aa  63.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64901  Nuclear Envelope Morphology  25.57 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>