20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3171 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_3171  predicted protein  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248181  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04490  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim50 Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4P0]  41.36 
 
 
532 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00295759  normal  0.0269512 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34411  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim50  36.15 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00066081  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52759  mitochondrial inner membrane protein required for protein import  37.56 
 
 
471 aa  132  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.581511 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05150  mitochondrial matrix protein import-related protein, putative  42.94 
 
 
516 aa  123  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03650  protein phosphatase, putative  36.53 
 
 
613 aa  102  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.382354  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8658  predicted protein  39.02 
 
 
195 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81784  predicted protein  31.74 
 
 
171 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.983288  normal  0.991644 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8327  predicted protein  33.76 
 
 
165 aa  85.5  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.989664 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10077  protein phosphatase (Eurofung)  31.18 
 
 
560 aa  82  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00228597  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15563  predicted protein  32.96 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01343  NIF domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09460)  31.58 
 
 
515 aa  72.8  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000375841  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7767  predicted protein  33.33 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03030  nuclear envelope-endoplasmic reticulum network protein, putative  35.63 
 
 
1305 aa  57.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04270  protein phosphatase, putative  37.25 
 
 
955 aa  57  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.520699  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14327  predicted protein  30.94 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64901  Nuclear Envelope Morphology  24.26 
 
 
401 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02902  CTD phosphatase-related (Eurofung)  32.08 
 
 
829 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.150265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5701  NLI interacting domain protein  25.2 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63097  predicted protein  32.35 
 
 
790 aa  42  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>