18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81784 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_81784  predicted protein  100 
 
 
171 aa  346  1e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.983288  normal  0.991644 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10077  protein phosphatase (Eurofung)  72 
 
 
560 aa  265  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00228597  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03650  protein phosphatase, putative  66.07 
 
 
613 aa  251  3e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.382354  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8327  predicted protein  53.16 
 
 
165 aa  189  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.989664 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8658  predicted protein  57.42 
 
 
195 aa  184  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7767  predicted protein  45.88 
 
 
190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15563  predicted protein  40.37 
 
 
224 aa  130  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01343  NIF domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09460)  41.04 
 
 
515 aa  124  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000375841  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34411  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim50  38.69 
 
 
237 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00066081  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64901  Nuclear Envelope Morphology  36.9 
 
 
401 aa  106  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04490  Mitochondrial import inner membrane translocase subunit tim50 Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4P0]  35.37 
 
 
532 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00295759  normal  0.0269512 
 
 
-
 
NC_006686  CND03030  nuclear envelope-endoplasmic reticulum network protein, putative  31.46 
 
 
1305 aa  100  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3171  predicted protein  31.74 
 
 
220 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.248181  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05150  mitochondrial matrix protein import-related protein, putative  32.12 
 
 
516 aa  93.2  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52759  mitochondrial inner membrane protein required for protein import  31.74 
 
 
471 aa  89  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.581511 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14327  predicted protein  30.9 
 
 
199 aa  85.1  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5701  NLI interacting domain protein  24.68 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.884506 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31529  predicted protein  26.55 
 
 
346 aa  40.8  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>