More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12373 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12373  predicted protein  100 
 
 
224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.54 
 
 
307 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.64 
 
 
308 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.64 
 
 
308 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.19 
 
 
308 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.19 
 
 
308 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.96 
 
 
313 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.19 
 
 
308 aa  275  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1406  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.19 
 
 
308 aa  275  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000428424  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.89 
 
 
307 aa  274  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2510  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.19 
 
 
308 aa  274  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000427922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1353  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.19 
 
 
308 aa  274  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000384606  hitchhiker  0.00895875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1418  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.19 
 
 
308 aa  274  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0628091  normal  0.474151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.89 
 
 
309 aa  273  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.09 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.3 
 
 
307 aa  272  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.19 
 
 
308 aa  271  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.82 
 
 
307 aa  270  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  61.16 
 
 
311 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.71 
 
 
309 aa  266  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.93 
 
 
312 aa  266  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.27 
 
 
310 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.4 
 
 
307 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.11 
 
 
308 aa  265  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.3 
 
 
307 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.93 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.27 
 
 
309 aa  264  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.27 
 
 
309 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  60.27 
 
 
309 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  59.46 
 
 
309 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  59.46 
 
 
309 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0147  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.56 
 
 
311 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100621  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.14 
 
 
311 aa  262  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.27 
 
 
309 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.11 
 
 
309 aa  262  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.27 
 
 
309 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.59 
 
 
309 aa  261  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  57.46 
 
 
321 aa  261  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.33 
 
 
308 aa  261  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.82 
 
 
310 aa  261  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  57.96 
 
 
312 aa  260  8.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.33 
 
 
311 aa  260  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.73 
 
 
314 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2706  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.82 
 
 
309 aa  258  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.796213  normal  0.172174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.26 
 
 
313 aa  258  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.89 
 
 
321 aa  258  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2134  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.89 
 
 
317 aa  256  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  58.93 
 
 
309 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.91 
 
 
309 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  57.08 
 
 
312 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  58.85 
 
 
314 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  59.29 
 
 
309 aa  254  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  59.56 
 
 
314 aa  254  9e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  59.38 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.18 
 
 
317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0931  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.78 
 
 
316 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.82 
 
 
310 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2551  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.5 
 
 
308 aa  252  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147723  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0820  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.33 
 
 
316 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2267  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.33 
 
 
310 aa  250  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0336576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  58.18 
 
 
309 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.36 
 
 
308 aa  250  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3780  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.53 
 
 
311 aa  249  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.6 
 
 
310 aa  248  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1262  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.57 
 
 
314 aa  248  4e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1217  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  53.57 
 
 
314 aa  248  4e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.215156  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  57.01 
 
 
314 aa  248  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  61.21 
 
 
308 aa  248  7e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.44 
 
 
311 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.14 
 
 
309 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0422  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.47 
 
 
310 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.52 
 
 
317 aa  248  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3480  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.04 
 
 
314 aa  247  8e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95014  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.44 
 
 
311 aa  247  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.33 
 
 
310 aa  247  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.44 
 
 
311 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.75 
 
 
308 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0545  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.04 
 
 
308 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56 
 
 
311 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56 
 
 
311 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.21 
 
 
310 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.44 
 
 
311 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  56.44 
 
 
311 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  56 
 
 
311 aa  245  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.44 
 
 
311 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  56 
 
 
315 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.44 
 
 
311 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.44 
 
 
311 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.44 
 
 
311 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  58.53 
 
 
310 aa  245  4e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.89 
 
 
311 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  57.33 
 
 
310 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.56 
 
 
311 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56 
 
 
311 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.44 
 
 
311 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0728  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.33 
 
 
309 aa  244  8e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.553162  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.75 
 
 
308 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.8 
 
 
313 aa  244  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  58.99 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.56 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>