More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1574 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1574  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  221  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  140  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  58.04 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  56.48 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  56.48 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  127  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 114 aa  126  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.68 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  50.89 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.68 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.89 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  52.68 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.68 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16421  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.68 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  123  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  123  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  123  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3024  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  51.79 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 114 aa  121  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.89 
 
 		 112 aa  121  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>