18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0900 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0900  putative transcription regulator with HTH domain  100 
 
 		 123 aa  247  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1948  putative transcription regulator  65 
 
 		 80 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0455  putative transcription regulator with HTH domain protein  43.33 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393695  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3645  helix-turn-helix domain protein  30.28 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4949  helix-turn-helix domain-containing protein  32.63 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.827096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1826  putative transcription regulator  46.3 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.273652  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2534  putative HTH-type transcriptional regulator,YgjM- like  30 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.431623  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5485  transcription regulator  31.58 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184827 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0775  helix-turn-helix domain protein  34.74 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1712  putative HTH-type transcriptional regulator,YgjM-like protein  29.17 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4425  transcriptional regulator, XRE family  31.31 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3978  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  0.384294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2129  transcription regulator containing HTH  34.02 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0265  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.153911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3932  helix-turn-helix domain-containing protein  33.66 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4803  hypothetical protein  28.42 
 
 		 128 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4862  helix-turn-helix domain-containing protein  35.82 
 
 		 124 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0755  transcriptional regulator, XRE family  24.14 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>