124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0838 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0838  O-methyltransferase family 2  100 
 
 		 379 aa  785    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.36 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  28.78 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  28.25 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  26.8 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  25.71 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  25.71 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  25.71 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  26.02 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.2 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  25.79 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.52 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.64 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  24.56 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.92 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  26.35 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.25 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.25 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  24.56 
 
 		 342 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1927  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  27.72 
 
 		 343 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.754339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.94 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  24 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2985  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.59 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2671  O-methyltransferase family 2  29.33 
 
 		 671 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2941  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.59 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  24.55 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.21 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.15 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.15 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.15 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  27.36 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  24.37 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  26.18 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2195  O-methyltransferase family protein  27.3 
 
 		 345 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5070  O-methyltransferase family 2  24.68 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.88726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  22.84 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3079  O-methyltransferase family 2  25.97 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  26.61 
 
 		 352 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2460  O-methyltransferase family protein  23.37 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14480  O-methyltransferase  24.76 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  23 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6864  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.09 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2537  O-methyltransferase family 2  24.32 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.12 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  31.36 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2214  O-methyltransferase family protein  25.76 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2830  O-methyltransferase family protein  26.47 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.585064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  22.33 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  22.69 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3177  O-methyltransferase family 2  22.42 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392119  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3051  O-methyltransferase family 2  24.45 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2170  O-methyltransferase family protein  24.84 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  22.55 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  26.2 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  29.73 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2098  hypothetical protein  29.09 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  20.93 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  20.62 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10889  conserved hypothetical protein  25.83 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.102495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  22.54 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4165  O-methyltransferase family protein  26.67 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  22.57 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2087  hypothetical protein  26.36 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04008  hypothetical O-methyltransferase (Eurofung)  24.23 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0690917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  28.19 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.17 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  27.56 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  26.61 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  27.71 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06952  conserved hypothetical protein  22.54 
 
 		 494 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.216189  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02609  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  31.58 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  30.7 
 
 		 373 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  23.08 
 
 		 343 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2082  methyltransferase type 12  20.34 
 
 		 339 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  27.1 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  28.46 
 
 		 334 aa  52.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  23.27 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  26.35 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05415  O-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02640)  25.14 
 
 		 459 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.173514 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  24.16 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09223  O-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02640)  25.14 
 
 		 289 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.386223  normal  0.97174 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00761  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00390915  normal  0.692825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  21.32 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  26.21 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0855  O-methyltransferase family protein  19.22 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  23.24 
 
 		 364 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  26.6 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09233  conserved hypothetical protein  26.62 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  28.46 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  27.64 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06945  O-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00390)  28.32 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2982  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37502  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4167  O-methyltransferase family protein  22.86 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1147  O-methyltransferase family 2  25.22 
 
 		 361 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  26.45 
 
 		 356 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  31.54 
 
 		 361 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  24.39 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1280  O-methyltransferase family protein, putative  22.78 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>