159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2830 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2830  O-methyltransferase family protein  100 
 
 
339 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.585064  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  48.07 
 
 
341 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0499  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  41.64 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.380967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0692  O-methyltransferase family 2  38.1 
 
 
337 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  39.75 
 
 
363 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  39.75 
 
 
363 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  39.75 
 
 
363 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1830  O-methyltransferase family 2  42.41 
 
 
336 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1767  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  41.69 
 
 
337 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2028  O-methyltransferase family protein  42.68 
 
 
354 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108247  normal  0.0687911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2460  O-methyltransferase family protein  40.45 
 
 
363 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.507965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0237  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  38.46 
 
 
362 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0247  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  38.46 
 
 
362 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  37.5 
 
 
384 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0227  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  38.13 
 
 
362 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2195  O-methyltransferase family protein  37.14 
 
 
345 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3940  O-methyltransferase family protein  39.37 
 
 
375 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1647  putative methyltransferase  38.22 
 
 
341 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6986  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  39.49 
 
 
334 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397091  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  39.56 
 
 
334 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2941  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  37.58 
 
 
399 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2985  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  37.58 
 
 
374 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0182  O-methyltransferase  37.9 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0273  O-methyltransferase  37.9 
 
 
341 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1145  O-methyltransferase family 2  40.58 
 
 
338 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  36.59 
 
 
336 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  39.17 
 
 
337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  40.56 
 
 
359 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0207  hypothetical protein  37.17 
 
 
341 aa  175  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4672  O-methyltransferase family 2  38.12 
 
 
344 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2966  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  31.37 
 
 
345 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.678001  normal  0.0331478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1927  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  34.23 
 
 
343 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.754339  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  32.23 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  34.74 
 
 
352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4382  O-methyltransferase family 2  35.92 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  36.33 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3051  O-methyltransferase family 2  38.11 
 
 
324 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243577  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  35.47 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3079  O-methyltransferase family 2  34.19 
 
 
354 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2537  O-methyltransferase family 2  37.15 
 
 
339 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  29.57 
 
 
387 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  29.41 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2671  O-methyltransferase family 2  37.46 
 
 
671 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2170  O-methyltransferase family protein  35.67 
 
 
332 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  29.37 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5070  O-methyltransferase family 2  29.49 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.88726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2214  O-methyltransferase family protein  38.26 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3177  O-methyltransferase family 2  34.36 
 
 
348 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392119  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14480  O-methyltransferase  32.78 
 
 
345 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6864  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  33.09 
 
 
340 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0838  O-methyltransferase family 2  26.47 
 
 
379 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.37 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  31.79 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  27.73 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10889  conserved hypothetical protein  28.9 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.102495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  30.86 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  30.86 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  30.6 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  28.94 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  29.49 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  28.3 
 
 
380 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08569  conserved hypothetical protein  31.97 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.06461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  28.8 
 
 
617 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  26.27 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  29.71 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00761  conserved hypothetical protein  25.45 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00390915  normal  0.692825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4597  O-methyltransferase family protein  25.38 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47611  normal  0.177854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  27.92 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06952  conserved hypothetical protein  24 
 
 
494 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.216189  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  24.21 
 
 
623 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06945  O-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00390)  27.97 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02398  O-methyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_2G17820)  26.61 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0753445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  26.91 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  28.44 
 
 
358 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  29.78 
 
 
346 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  24.22 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0437  O-methyltransferase family 2  23.94 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0771305  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2982  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  32.99 
 
 
396 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37502  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  26.73 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  27.27 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1612  O-methyltransferase family protein  29.89 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02609  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 
419 aa  63.2  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0784  O-methyltransferase family 2  31.94 
 
 
554 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  23.62 
 
 
339 aa  62.8  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  27.73 
 
 
354 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5557  O-methyltransferase family protein  23.82 
 
 
352 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3676  O-methyltransferase family 2  25.16 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410958  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  25.64 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  27.38 
 
 
368 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  27.45 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3149  methyltransferase type 12  29.43 
 
 
327 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12076  normal  0.050117 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09233  conserved hypothetical protein  32.69 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10577  methyltransferase  24.43 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.989872 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5718  O-methyltransferase family 2  26.73 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2820  O-methyltransferase family protein  27.57 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0277068  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  27.96 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7514  hypothetical protein  29.87 
 
 
330 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  24.76 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>