110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3803 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_3803  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  100 
 
 
326 aa  648    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3205  Bile acid:sodium symporter  27.57 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245995 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0112  hypothetical protein  26.57 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0657186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2407  Bile acid:sodium symporter  26.96 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195437  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2813  Bile acid:sodium symporter  25.76 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0326  Bile acid:sodium symporter  24.22 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0453748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4831  putative symporter family protein  25.35 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33387  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  29.66 
 
 
385 aa  69.3  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307134  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2538  lipoprotein transmembrane  26.44 
 
 
358 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2501  bile acid:sodium symporter  26.35 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3613  bile acid:sodium symporter  29.2 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423949  hitchhiker  0.00964207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2565  bile acid/Na+ symporter family protein  25.08 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000897855  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2697  bile acid/Na+ symporter family protein  24.83 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000209356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3641  sodium:bile acid symporter family protein  24.83 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000261961  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2770  sodium:bile acid symporter family protein  24.83 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264758  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2103  Bile acid:sodium symporter  25.9 
 
 
348 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3818  bile acid:sodium symporter  27.27 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3465  bile acid:sodium symporter  23.78 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.440703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02309  predicted inner membrane protein  24.49 
 
 
332 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000832535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1252  Bile acid:sodium symporter  24.49 
 
 
332 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000190028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4216  Bile acid:sodium symporter  24.92 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2544  bile acid/Na+ symporter family protein  24.49 
 
 
332 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000983747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1269  bile acid:sodium symporter  24.49 
 
 
332 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000908139  hitchhiker  0.000128844 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02270  hypothetical protein  24.49 
 
 
332 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000838069  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2618  bile acid/Na+ symporter family protein  25.26 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2684  bile acid/Na+ symporter family transporter  24.91 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68374  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2660  transporter bile acid/Na+ symporter family  24.91 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2569  transporter, bile acid/Na+ symporter family  24.91 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000515206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2790  bile acid/Na+ symporter family transporter  24.91 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2382  bile acid:sodium symporter  27.55 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38498  predicted protein  23.89 
 
 
458 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2334  Bile acid:sodium symporter  22.76 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.87771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2034  Bile acid:sodium symporter  22.76 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2714  bile acid:sodium symporter  22.48 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.476045  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  26.69 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04030  bile acid/sodium symporter  25.9 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0866  bile acid:sodium symporter  25.23 
 
 
339 aa  59.7  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.299881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2937  bile acid:sodium symporter  23.47 
 
 
331 aa  59.3  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.120648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17200  predicted Na+-dependent transporter  26.46 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3177  bile acid:sodium symporter  24.76 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98524  normal  0.0121029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0807  Bile acid:sodium symporter  24.33 
 
 
357 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.308554 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0247  bile acid:sodium symporter  24.62 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2144  Bile acid:sodium symporter  21.83 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0527  hypothetical protein  23.49 
 
 
363 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000523356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  29.27 
 
 
303 aa  55.8  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48117  predicted protein  22.6 
 
 
429 aa  55.8  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2904  bile acid:sodium symporter  25.85 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.731183  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3320  Bile acid:sodium symporter  24.85 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5029  hypothetical protein  24.78 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3255  bile acid:sodium symporter  23.8 
 
 
332 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3838  Na+-dependent transporter-like protein  26.3 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2250  hypothetical protein  24.91 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0525  bile acid:sodium symporter  25 
 
 
336 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2181  bile acid:sodium symporter  26.07 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1906  Bile acid:sodium symporter  22.34 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2877  bile acid/Na+ symporter family protein  26.19 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3390  sodium/bile acid symporter family protein  24.14 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3064  sodium/bile acid symporter family protein  24.14 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2029  sodium/bile acid symporter family protein  24.14 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0339  sodium/bile acid symporter family protein  24.14 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0352  sodium/bile acid symporter family protein  24.14 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2255  sodium/bile acid symporter family protein  24.14 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2812  bile acid:sodium symporter  26.19 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.885659  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  26.57 
 
 
293 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2484  bile acid:sodium symporter  24.77 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.846841  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3716  Bile acid:sodium symporter  25.53 
 
 
343 aa  52.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0440669 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0532  sodium/bile acid symporter family protein  24.14 
 
 
382 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1861  hypothetical protein  26.34 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0440026  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0139  hypothetical protein  23.01 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3619  Bile acid:sodium symporter  21.65 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0321  Bile acid:sodium symporter  23.83 
 
 
323 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.15131 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  35.14 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1880  putative sodium/bile acid symporter family protein  22.57 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1064  sodium/bile acid symporter family protein  25.21 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0585  lipoprotein transmembrane  22.26 
 
 
341 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4668  Na+-dependent transporter-like protein  25.24 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2427  bile acid:sodium symporter  21.28 
 
 
335 aa  50.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574524  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4465  bile acid:sodium symporter  24.67 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1029  sodium/bile acid symporter family protein  25.21 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2738  hypothetical protein  23.34 
 
 
329 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.889143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1994  hypothetical protein  22.57 
 
 
342 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0152  bile acid:sodium symporter  24.05 
 
 
340 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  26.63 
 
 
298 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3402  hypothetical protein  23.34 
 
 
329 aa  49.3  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431314  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1364  hypothetical protein  22.83 
 
 
340 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.953103  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2148  bile acid:sodium symporter  24.32 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2266  putative sodium/bile acid symporter family protein  22.57 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2990  bile acid:sodium symporter  26.02 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36253  predicted protein  24.38 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6319  bile acid/sodium symporter  25.61 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2356  bile acid:sodium symporter  25.61 
 
 
343 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385828  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3017  bile acid:sodium symporter  25.61 
 
 
347 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2970  bile acid:sodium symporter  25.61 
 
 
343 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0427  Bile acid:sodium symporter  23.33 
 
 
342 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2965  bile acid:sodium symporter  25.2 
 
 
343 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4937  Bile acid:sodium symporter  23.45 
 
 
335 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0302  sodium/bile acid symporter family protein  21.6 
 
 
394 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2880  bile acid:sodium symporter  25.61 
 
 
347 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3442  bile acid:sodium symporter  21.52 
 
 
330 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176045  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38320  bile acid/Na+ symporter family transporter  21.39 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277216 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>