297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33006 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_33006  predicted protein  100 
 
 
117 aa  225  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533231  normal  0.671898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  88.37 
 
 
44 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  86.05 
 
 
44 aa  72.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  86.05 
 
 
44 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0301  ribosomal protein L34  88.37 
 
 
44 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3505  50S ribosomal protein L34  83.72 
 
 
44 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0561624 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  81.4 
 
 
44 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  81.4 
 
 
44 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  81.4 
 
 
44 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  75.56 
 
 
46 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  81.4 
 
 
44 aa  68.2  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  81.4 
 
 
44 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  81.4 
 
 
44 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  81.4 
 
 
44 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  79.07 
 
 
44 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  81.4 
 
 
44 aa  66.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  79.07 
 
 
44 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3614  50S ribosomal protein L34P  79.07 
 
 
44 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0374  50S ribosomal protein L34  79.07 
 
 
44 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136246  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
45 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 
44 aa  63.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0575  50S ribosomal protein L34P  79.07 
 
 
44 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1923  ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360923  normal  0.510099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0333  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0642  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
45 aa  62  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0779335  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
44 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7324  50S ribosomal subunit protein L34  80.85 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0819  50S ribosomal protein L34  93.33 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  69.77 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 
44 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
44 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000343039  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47740  predicted protein  62.75 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.889285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
45 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  57.4  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3326  ribosomal protein L34  86.67 
 
 
44 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5079  50S ribosomal protein L34  86.67 
 
 
44 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.467706 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11230  60S ribosomal protein L34 (AFU_orthologue; AFUA_4G07605)  70 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.495019 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
44 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  69.05 
 
 
52 aa  57  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3076  50S ribosomal protein L34  90 
 
 
44 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797774  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0638  50S ribosomal protein L34  90 
 
 
44 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257462  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2603  ribosomal protein L34  73.81 
 
 
46 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15416  normal  0.859083 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0685  50S ribosomal protein L34  90 
 
 
44 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0856  ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  56.6  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3705  50S ribosomal protein L34  86.67 
 
 
44 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  73.81 
 
 
44 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 
52 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  66.67 
 
 
55 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2226  50S ribosomal protein L34  82.22 
 
 
46 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248276  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0005  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
45 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000407109  unclonable  0.0000000000598342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0201  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  55.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0578075  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2238  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3184  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3101  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000038228 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3400  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4328  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
45 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000182239  unclonable  0.00000000000165538 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3157  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  71.43 
 
 
46 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4005  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
45 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000152105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6523  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4382  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
45 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000590105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
44 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2847  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.565052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3238  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.303962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3553  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3778  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
45 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000138281  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0090  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0104  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2552  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941562  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3943  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
45 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000682615  unclonable  0.0000000000163779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4035  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
45 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  unclonable  0.0000123729 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4066  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
45 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000570066  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3218  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535057  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2316  50S ribosomal protein L34  82.22 
 
 
46 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.464371  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1787  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000418324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3166  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  73.17 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4524  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
45 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000909572  hitchhiker  0.00010277 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3102  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0409092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3989  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4383  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
45 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 
46 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  66.67 
 
 
54 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1628  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.499577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
46 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4260  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 
45 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000224998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3869  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 
45 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000185495  unclonable  0.00000233405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>