More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1787 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1787  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  85.9  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000418324  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  95.45 
 
 		 44 aa  83.6  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000343039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  83.33 
 
 		 44 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 45 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 45 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  77.27 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0856  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1923  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360923  normal  0.510099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0374  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1046  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0456047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 52 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 53 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0301  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  73.81 
 
 		 50 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  71.43 
 
 		 52 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 53 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 53 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0313  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0872  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 45 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0649  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.485643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  76.92 
 
 		 53 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0357  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.0448083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 46 aa  57.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3336  50S ribosomal protein L34P  68.18 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.754449  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  71.43 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0333  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4388  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000381173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 46 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 52 aa  57.4  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 46 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  69.77 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0005  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000814875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 46 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0583  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.0000248165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0440  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.046605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  65.91 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2935  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000367166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00438  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 51 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3852  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002013  LSU ribosomal protein L34p  62.79 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  69.23 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3553  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>